臺北醫學大學原名臺北醫學院，創立于1960年6月1日，是醫學專家暨熱心醫藥教育人士胡水旺先生與徐千田先生等所捐資創設。創校之初，校地盡是一片荒蕪水田，教學與研究資源匱乏，四十八年來，在歷屆校(xiao)長的努(nu)力下，從(cong)創校(xiao)之三(san)(san)學(xue)(xue)系二(er)專科，擴展(zhan)為現有(you)醫學(xue)(xue)院(yuan)、口(kou)腔醫學(xue)(xue)院(yuan)、藥學(xue)(xue)院(yuan)、護(hu)理學(xue)(xue)院(yuan)、公共衛生暨營養學(xue)(xue)院(yuan)五(wu)個學(xue)(xue)院(yuan)，十三(san)(san)學(xue)(xue)系及十三(san)(san)研究所(suo)之規模(mo)。自(zi)從(cong)2000年改名臺(tai)北醫學(xue)(xue)大學(xue)(xue)以(yi)來，便一直(zhi)以(yi)成(cheng)為國際一流醫學(xue)(xue)大學(xue)(xue)為目標，持續(xu)努(nu)力。
在教(jiao)(jiao)(jiao)學(xue)(xue)方面，作為(wei)一所都會型醫(yi)(yi)學(xue)(xue)專業大學(xue)(xue)，臺北醫(yi)(yi)學(xue)(xue)大學(xue)(xue)的教(jiao)(jiao)(jiao)育理(li)(li)念，在于(yu)教(jiao)(jiao)(jiao)導學(xue)(xue)生(sheng)醫(yi)(yi)學(xue)(xue)專業知識(shi)之外(wai)，同時重(zhong)視博雅教(jiao)(jiao)(jiao)育，回歸以人(ren)為(wei)本的教(jiao)(jiao)(jiao)學(xue)(xue)。在這樣的理(li)(li)念上(shang)，自2006年(nian)起，連續三年(nian)獲得教(jiao)(jiao)(jiao)育部教(jiao)(jiao)(jiao)學(xue)(xue)卓越計劃補助，獲得肯定。為(wei)落(luo)實(shi)該(gai)校結合醫(yi)(yi)學(xue)(xue)科(ke)技與(yu)人(ren)文教(jiao)(jiao)(jiao)育的理(li)(li)想，深化人(ren)文與(yu)通(tong)識(shi)教(jiao)(jiao)(jiao)育，學(xue)(xue)校以專業教(jiao)(jiao)(jiao)育通(tong)識(shi)化、通(tong)識(shi)教(jiao)(jiao)(jiao)育專業化為(wei)兩(liang)大主軸，持(chi)續貫徹教(jiao)(jiao)(jiao)學(xue)(xue)品質(zhi)與(yu)績效的目標。
在研究方面，頂尖(jian)(jian)研究是國際(ji)一(yi)(yi)(yi)流(liu)大(da)學(xue)不(bu)可或缺之一(yi)(yi)(yi)環(huan)，臺北醫學(xue)大(da)學(xue)過(guo)去幾(ji)年來，研究水準已有長(chang)足的(de)進(jin)步。為持(chi)續朝向世界(jie)前五百大(da)頂尖(jian)(jian)大(da)學(xue)，學(xue)校順應(ying)國際(ji)趨勢，極力爭取(qu)大(da)型(xing)及(ji)整合(he)型(xing)研究計(ji)劃，延攬國內外杰出人才及(ji)其團(tuan)隊，提高研究獎勵(li)，并建(jian)立與(yu)國際(ji)一(yi)(yi)(yi)流(liu)研究單位合(he)作(zuo)關系(xi)。
在(zai)醫(yi)(yi)(yi)療方面，隨(sui)著教學(xue)研究的成長，該(gai)校醫(yi)(yi)(yi)療體系也日漸(jian)茁壯。臺北(bei)醫(yi)(yi)(yi)學(xue)大(da)學(xue)擁(yong)有附(fu)設醫(yi)(yi)(yi)院(yuan)、萬芳醫(yi)(yi)(yi)院(yuan)、雙(shuang)和醫(yi)(yi)(yi)院(yuan)，三(san)所附(fu)屬醫(yi)(yi)(yi)院(yuan)，近三(san)千床之規模(mo)，是(shi)為(wei)臺北(bei)地區醫(yi)(yi)(yi)學(xue)院(yuan)校最大(da)之醫(yi)(yi)(yi)療體系。臺北(bei)醫(yi)(yi)(yi)學(xue)大(da)學(xue)統(tong)合學(xue)校及(ji)三(san)附(fu)屬醫(yi)(yi)(yi)院(yuan)的資源，在(zai)見、實習與(yu)臨(lin)床技(ji)能訓練上(shang)，具有完整的設備與(yu)空(kong)間，更以服(fu)務鄰(lin)近社區，保(bao)障國(guo)人(ren)健康(kang)為(wei)職志(zhi)。
洪奇昌：民主進(jin)步(bu)黨立法委員
林益世：國民(min)黨立法(fa)委員(yuan)
侯文詠：麻醉醫(yi)師、知名作家
張洪(hong)量：牙醫(yi)系畢業(ye)，流(liu)行音樂歌(ge)手、制作(zuo)人
隆中隱：知名中國音樂教育者
陳(chen)以生：牙醫系(xi)學(xue)士(shi)、口研(yan)所碩士(shi)，流行音(yin)樂歌手
陳(chen)子(zi)忠(zhong)：醫技系學士、中港臺醫療(liao)管理(li)人員
李良雄：臺北榮民總醫院(yuan)院(yuan)長
1958年，創辦人胡水旺先(xian)生、徐千田先(xian)生籌設北醫。
1960年，北醫創立，當時(shi)有醫學系、牙醫學系及藥學系三系。
1963年，成立護(hu)理(li)助產專修(xiu)科，招收五專生。
1965年，成立(li)醫事技術專修科，招收五專生。
1975年，醫事技術專修科改制(zhi)為醫事技術學系。
1976年，設立臺北醫學大學附(fu)設醫院。
1977年，護理助產專修(xiu)科改(gai)制為護理學系。
1979年(nian)，成(cheng)立保(bao)健(jian)營養學系。
1989年，成(cheng)立公共衛生學系。
1989年(nian)，成立天然(ran)物醫學研(yan)究所。
1990年，胡俊(jun)弘先生接任校長，成立醫(yi)學研究所。
1992年(nian)，成立口腔復健醫學(xue)研究(jiu)所。
1993年，口腔復健醫學(xue)(xue)研(yan)究所(suo)改名為牙醫學(xue)(xue)研(yan)究所(suo)。天(tian)然物醫學(xue)(xue)研(yan)究所(suo)改名為醫學(xue)(xue)研(yan)究所(suo)。
1994年，成立細胞及分子生(sheng)物研究所(suo)。領先全國各(ge)校(xiao)成立「醫學資訊暨電子計算(suan)機(ji)中心」。
1995年，成立保健(jian)營養學(xue)(xue)研(yan)究(jiu)(jiu)所碩(shuo)士班。護理學(xue)(xue)研(yan)究(jiu)(jiu)所碩(shuo)士班。
1996年，接收臺北市(shi)政府(fu)委托(tuo)經營(ying)市(shi)立萬芳醫(yi)院。
1997年(nian)，成立醫(yi)務管理(li)學系。
1998年，成立生物醫(yi)(yi)學技術研究(jiu)所、醫(yi)(yi)學資(zi)訊研究(jiu)所。
1999年，成立生藥(yao)技(ji)術學系，是臺灣第一個中藥(yao)相關學系。由當(dang)時藥(yao)學院(yuan)院(yuan)長楊玲(ling)玲(ling)教授所(suo)創立,但由於藥(yao)師全(quan)聯(lian)會的反(fan)對,迫使2007年停止招(zhao)生。
2000年，改名「臺北醫學大學」，成(cheng)立醫務管理研究所、生物醫學材(cai)料研究所。
2001年，成立呼吸治(zhi)療學系、口腔衛生學系。
2002年，成(cheng)立(li)藥(yao)理學研(yan)(yan)究所(suo)、口腔科學研(yan)(yan)究所(suo)、保健營養研(yan)(yan)究所(suo)博士班。
2003年(nian)，通過衛生(sheng)署甄選，籌(chou)建雙和醫(yi)院，并成(cheng)立醫(yi)學人文研究所。
2004年，成立(li)神經科(ke)學研究所。
2006年(nian)，口腔科(ke)學(xue)(xue)研(yan)究(jiu)所(suo)與(yu)生醫(yi)材料研(yan)究(jiu)所(suo)合并，改(gai)名(ming)為(wei)生醫(yi)材料暨(ji)工程研(yan)究(jiu)所(suo)。護理學(xue)(xue)研(yan)究(jiu)所(suo)博士班成(cheng)立、醫(yi)事技術學(xue)(xue)系(xi)改(gai)名(ming)為(wei)醫(yi)學(xue)(xue)檢驗暨(ji)生物技術學(xue)(xue)系(xi)。
2007年，成(cheng)立牙體技(ji)術學(xue)系、老人護理暨管理學(xue)系。由原先的(de)醫(yi)學(xue)研(yan)究(jiu)所基礎組(zu)、細胞及分子生物研(yan)究(jiu)所、醫(yi)學(xue)檢(jian)驗暨生物技(ji)術學(xue)系碩士班、藥理學(xue)研(yan)究(jiu)所及神經科學(xue)研(yan)究(jiu)所五(wu)所整合(he)為醫(yi)學(xue)科學(xue)研(yan)究(jiu)所。
2008年，附屬醫院(yuan)-雙和(he)醫院(yuan)於(wu)7月1日開(kai)始營運、邱文達教授(shou)接(jie)任校長
2009年，醫務管理學系并入公共衛生暨營養學院，開(kai)始招收碩士班國際學生。
2010年(nian)，成立(li)醫學(xue)科技學(xue)院、人文暨社會科學(xue)院。
2011年(nian)，榮獲(huo)QS亞洲頂尖大學前百大。連續六(liu)年(nian)獲(huo)教育(yu)部補(bu)助近4億元。
2011年，邱文達校(xiao)長榮陞衛生署署長，閻云(yun)教授接(jie)任(ren)北醫第九任(ren)校(xiao)長。
2013年，老人護(hu)理(li)暨管理(li)學系更名為高齡健康管理(li)學系。
2014年，藥(yao)學(xue)(xue)系(xi)分(fen)設藥(yao)學(xue)(xue)組、臨(lin)床藥(yao)學(xue)(xue)組。
2015年(nian)，成立(li)管(guan)理(li)(li)(li)學(xue)(xue)院，并將公(gong)共衛生暨(ji)營(ying)養學(xue)(xue)院中的「醫務(wu)管(guan)理(li)(li)(li)學(xue)(xue)系（學(xue)(xue)士班(ban)、碩(shuo)士班(ban)、碩(shuo)士在職專(zhuan)班(ban)）」整并至管(guan)理(li)(li)(li)學(xue)(xue)院。
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