臺北醫學大學原名臺北醫學院，創立于1960年6月1日，是醫學專家暨熱心醫藥教育人士胡水旺先生與徐千田先生等所捐資創設。創校之初，校地盡是一片荒蕪水田，教學與研究資源匱乏，四十八年來，在(zai)歷(li)屆校(xiao)(xiao)長的努(nu)力下，從創校(xiao)(xiao)之三學(xue)系(xi)二專科(ke)，擴展為現有醫學(xue)院(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)、口(kou)腔(qiang)醫學(xue)院(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)、藥學(xue)院(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)、護(hu)理(li)學(xue)院(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)、公共(gong)衛生暨營(ying)養學(xue)院(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)五個學(xue)院(yuan)(yuan)(yuan)(yuan)，十三學(xue)系(xi)及十三研究(jiu)所(suo)之規模。自(zi)從2000年改名臺北醫學(xue)大學(xue)以來，便一直以成為國際一流醫學(xue)大學(xue)為目標，持續努(nu)力。
在(zai)教(jiao)(jiao)(jiao)學(xue)(xue)(xue)方面，作為(wei)一所都會型醫學(xue)(xue)(xue)專(zhuan)業大學(xue)(xue)(xue)，臺北醫學(xue)(xue)(xue)大學(xue)(xue)(xue)的(de)教(jiao)(jiao)(jiao)育理念，在(zai)于教(jiao)(jiao)(jiao)導學(xue)(xue)(xue)生醫學(xue)(xue)(xue)專(zhuan)業知識之外，同(tong)時重視(shi)博雅教(jiao)(jiao)(jiao)育，回歸以(yi)人(ren)(ren)為(wei)本(ben)的(de)教(jiao)(jiao)(jiao)學(xue)(xue)(xue)。在(zai)這樣的(de)理念上，自2006年起，連續(xu)三年獲得(de)教(jiao)(jiao)(jiao)育部(bu)教(jiao)(jiao)(jiao)學(xue)(xue)(xue)卓越計(ji)劃補助，獲得(de)肯(ken)定(ding)。為(wei)落(luo)實該(gai)校結(jie)合醫學(xue)(xue)(xue)科(ke)技與(yu)人(ren)(ren)文(wen)教(jiao)(jiao)(jiao)育的(de)理想，深化(hua)人(ren)(ren)文(wen)與(yu)通(tong)識教(jiao)(jiao)(jiao)育，學(xue)(xue)(xue)校以(yi)專(zhuan)業教(jiao)(jiao)(jiao)育通(tong)識化(hua)、通(tong)識教(jiao)(jiao)(jiao)育專(zhuan)業化(hua)為(wei)兩大主軸，持續(xu)貫徹教(jiao)(jiao)(jiao)學(xue)(xue)(xue)品質與(yu)績效的(de)目標。
在研(yan)究方面，頂尖研(yan)究是國(guo)(guo)際一流(liu)(liu)大學(xue)(xue)不可或(huo)缺之一環，臺北醫(yi)學(xue)(xue)大學(xue)(xue)過去(qu)幾年(nian)來，研(yan)究水準(zhun)已有長足(zu)的進(jin)步。為持續朝向世界前五百大頂尖大學(xue)(xue)，學(xue)(xue)校(xiao)順應國(guo)(guo)際趨勢，極力爭取大型及(ji)整合(he)型研(yan)究計劃，延攬國(guo)(guo)內外(wai)杰出人才及(ji)其團(tuan)隊，提高研(yan)究獎勵，并建立與(yu)國(guo)(guo)際一流(liu)(liu)研(yan)究單位合(he)作關系。
在醫(yi)(yi)(yi)(yi)療(liao)方面(mian)，隨著教學研(yan)究的成(cheng)長，該校(xiao)(xiao)醫(yi)(yi)(yi)(yi)療(liao)體系(xi)(xi)也日漸茁壯。臺(tai)(tai)北(bei)醫(yi)(yi)(yi)(yi)學大學擁有(you)附(fu)設醫(yi)(yi)(yi)(yi)院(yuan)、萬芳醫(yi)(yi)(yi)(yi)院(yuan)、雙和醫(yi)(yi)(yi)(yi)院(yuan)，三所(suo)附(fu)屬醫(yi)(yi)(yi)(yi)院(yuan)，近(jin)(jin)三千床之(zhi)規(gui)模，是為(wei)(wei)臺(tai)(tai)北(bei)地區醫(yi)(yi)(yi)(yi)學院(yuan)校(xiao)(xiao)最(zui)大之(zhi)醫(yi)(yi)(yi)(yi)療(liao)體系(xi)(xi)。臺(tai)(tai)北(bei)醫(yi)(yi)(yi)(yi)學大學統合學校(xiao)(xiao)及三附(fu)屬醫(yi)(yi)(yi)(yi)院(yuan)的資源，在見(jian)、實(shi)習與臨床技(ji)能訓練上，具有(you)完整的設備與空(kong)間，更以(yi)服務鄰(lin)近(jin)(jin)社區，保障國(guo)人健康(kang)為(wei)(wei)職志。
洪(hong)奇昌：民主(zhu)進步(bu)黨(dang)立法委(wei)員
林益世：國民黨立法委(wei)員
侯文詠(yong)：麻醉醫(yi)師、知名作(zuo)家
張(zhang)洪量：牙醫系畢業(ye)，流行音(yin)樂歌手(shou)、制作人
隆中隱：知名中國音樂教(jiao)育者(zhe)
陳(chen)以生：牙醫系學士、口研所碩士，流行音樂歌手
陳子忠：醫技(ji)系學士、中港臺(tai)醫療(liao)管理(li)人(ren)員
李良雄：臺北(bei)榮民總醫院院長
1958年(nian)，創辦人胡水旺先生、徐千(qian)田先生籌設北醫。
1960年，北(bei)醫創立，當時有醫學系、牙醫學系及(ji)藥學系三系。
1963年，成立(li)護理助產專(zhuan)修科，招收五專(zhuan)生。
1965年，成立(li)醫事技術(shu)專修科，招收五專生。
1975年，醫(yi)事技術專修科改制為醫(yi)事技術學系(xi)。
1976年，設立臺北醫(yi)學大(da)學附設醫(yi)院。
1977年，護理(li)(li)助產專修科改制為護理(li)(li)學(xue)系。
1979年，成立保健營養學系。
1989年，成立(li)公(gong)共衛(wei)生學系。
1989年，成(cheng)立天然物(wu)醫(yi)學研究所(suo)。
1990年，胡(hu)俊(jun)弘先生(sheng)接任校長，成立(li)醫學研究所。
1992年，成立口腔復健醫學研究所。
1993年，口腔復(fu)健醫(yi)(yi)學(xue)研(yan)(yan)究所(suo)改(gai)名為牙(ya)醫(yi)(yi)學(xue)研(yan)(yan)究所(suo)。天(tian)然物醫(yi)(yi)學(xue)研(yan)(yan)究所(suo)改(gai)名為醫(yi)(yi)學(xue)研(yan)(yan)究所(suo)。
1994年，成(cheng)立細胞及分(fen)子生物研(yan)究所。領先全國(guo)各校成(cheng)立「醫學(xue)資訊(xun)暨電(dian)子計算(suan)機中心(xin)」。
1995年，成立保(bao)健營養(yang)學(xue)研究所碩士班。護理學(xue)研究所碩士班。
1996年，接收臺北市(shi)政府委托經營(ying)市(shi)立(li)萬芳醫院(yuan)。
1997年，成立醫務管(guan)理學(xue)系(xi)。
1998年(nian)，成立生物醫學技術研(yan)究所、醫學資訊研(yan)究所。
1999年(nian)，成立生(sheng)藥(yao)技術學(xue)系，是臺灣第一個(ge)中藥(yao)相(xiang)關(guan)學(xue)系。由當時藥(yao)學(xue)院院長楊玲玲教授所創立,但由於(wu)藥(yao)師(shi)全聯會的反(fan)對,迫使2007年(nian)停止招(zhao)生(sheng)。
2000年，改名「臺北醫學大學」，成立醫務(wu)管(guan)理研究所、生(sheng)物醫學材料研究所。
2001年(nian)，成立呼(hu)吸治療學(xue)系、口(kou)腔衛生學(xue)系。
2002年，成(cheng)立藥理學研(yan)究(jiu)(jiu)所、口腔科學研(yan)究(jiu)(jiu)所、保健(jian)營養研(yan)究(jiu)(jiu)所博士(shi)班。
2003年，通(tong)過衛生署甄選，籌建(jian)雙(shuang)和醫(yi)院，并(bing)成立醫(yi)學人文(wen)研究所。
2004年，成(cheng)立神經科學研究所。
2006年，口腔科(ke)學研(yan)究(jiu)所與生(sheng)醫材料研(yan)究(jiu)所合并(bing)，改名為生(sheng)醫材料暨工程(cheng)研(yan)究(jiu)所。護理學研(yan)究(jiu)所博士班成(cheng)立、醫事技術(shu)學系(xi)改名為醫學檢驗暨生(sheng)物技術(shu)學系(xi)。
2007年(nian)，成立牙體技術(shu)學(xue)系(xi)(xi)、老人護理暨管理學(xue)系(xi)(xi)。由原先的醫學(xue)研(yan)究(jiu)所(suo)(suo)基礎組(zu)、細胞及分(fen)子生(sheng)物(wu)研(yan)究(jiu)所(suo)(suo)、醫學(xue)檢驗暨生(sheng)物(wu)技術(shu)學(xue)系(xi)(xi)碩(shuo)士班、藥理學(xue)研(yan)究(jiu)所(suo)(suo)及神經科(ke)學(xue)研(yan)究(jiu)所(suo)(suo)五所(suo)(suo)整合為(wei)醫學(xue)科(ke)學(xue)研(yan)究(jiu)所(suo)(suo)。
2008年，附屬醫(yi)院-雙(shuang)和醫(yi)院於(wu)7月(yue)1日開始(shi)營運(yun)、邱文達教(jiao)授接任校(xiao)長
2009年(nian)，醫(yi)務管理學(xue)系(xi)并入公共衛(wei)生暨營養學(xue)院，開始(shi)招收(shou)碩(shuo)士班國際學(xue)生。
2010年(nian)，成立醫學(xue)科(ke)技(ji)學(xue)院、人文暨社會(hui)科(ke)學(xue)院。
2011年(nian)，榮獲QS亞洲頂尖大學前(qian)百大。連(lian)續六年(nian)獲教育部補助近4億元。
2011年，邱文達(da)校長(chang)榮陞(sheng)衛生署(shu)(shu)署(shu)(shu)長(chang)，閻云(yun)教授接任(ren)北(bei)醫第九任(ren)校長(chang)。
2013年，老人護理暨(ji)管理學系更名為高齡健(jian)康(kang)管理學系。
2014年(nian)，藥學(xue)系(xi)分設藥學(xue)組(zu)(zu)、臨(lin)床藥學(xue)組(zu)(zu)。
2015年，成立管理學(xue)院(yuan)，并將公共衛生暨營養學(xue)院(yuan)中的「醫務管理學(xue)系（學(xue)士(shi)班(ban)、碩士(shi)班(ban)、碩士(shi)在職專班(ban)）」整并至管理學(xue)院(yuan)。
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