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保護(hu)區位(wei)于甘肅省(sheng)西(xi)(xi)端的敦(dun)煌市南(nan)湖鄉境內，總面(mian)積8.81777萬(wan)公頃，東(dong)為黨河水庫，西(xi)(xi)隔甘肅敦(dun)煌西(xi)(xi)湖國家級自然(ran)保護(hu)區而見一望無際的庫姆塔格沙(sha)漠，南(nan)接阿克(ke)(ke)賽哈(ha)薩克(ke)(ke)族自治縣，北(bei)面(mian)則是大面(mian)積的戈壁荒漠。
全區(qu)年(nian)降水量平均值為36.8--153.8毫米,年(nian)日照時(shi)數3033.4--3316.5小時(shi)，具有(you)典型的大(da)陸性荒漠氣候特點。
敦煌陽(yang)關自(zi)然保護區始建(jian)于(yu)1992年，地(di)處河西走廊坳陷(xian)之西端，祁連山(shan)褶皺(zhou)帶，位于(yu)瓜州—敦煌盆(pen)地(di)西南邊緣的陽(yang)關小(xiao)盆(pen)地(di)。
1994年(nian)經省政府批(pi)準晉(jin)升為(wei)省級自然保護區。
2006年(nian)，為了認真貫徹(che)落(luo)實溫家(jia)寶總理關(guan)于(yu)“敦煌生態保護工作(zuo)，必須高度重視，科學規劃，綜合治理，加快(kuai)進行。“絕不能讓敦煌變(bian)成第二個(ge)樓(lou)蘭”的(de)重要批示精神，敦煌市(shi)政府在(zai)國家(jia)環保部的(de)指導下，正式啟動了敦煌陽關(guan)省級自(zi)然(ran)保護區(qu)(qu)晉升國家(jia)級自(zi)然(ran)保護區(qu)(qu)的(de)申報(bao)工作(zuo)。
2009年(nian)9月正式(shi)獲得(de)了國務院的審批命名(ming)，晉升為(wei)國家級自然保護區。
敦煌陽關國(guo)家級自然保護區總面(mian)積(ji)為(wei)8.81777萬公頃，其(qi)中核(he)心區面(mian)積(ji)為(wei)2.7322萬公頃，緩(huan)沖(chong)區面(mian)積(ji)為(wei)2.80826萬公頃，實驗區面(mian)積(ji)為(wei)3.27731萬公頃。
敦(dun)煌市氣(qi)象局為(wei)陽關自然保護(hu)區(qu)(qu)和西(xi)湖自然保護(hu)區(qu)(qu)建立了(le)無人區(qu)(qu)域自動站以及敦(dun)煌市建成的西(xi)北(bei)地區(qu)(qu)戈壁(bi)荒漠生(sheng)態與環境研究(jiu)站，為(wei)自然保護(hu)區(qu)(qu)的保護(hu)和發(fa)展提供(gong)了(le)科學依(yi)據和氣(qi)象保障。
保(bao)(bao)(bao)護(hu)區(qu)(qu)是(shi)中國(guo)西部干旱荒漠區(qu)(qu)中較為罕見的(de)(de)特殊(shu)成因(yin)內陸河流(liu)生態系統，保(bao)(bao)(bao)護(hu)區(qu)(qu)的(de)(de)濕地是(shi)中國(guo)西部荒漠區(qu)(qu)重要的(de)(de)候(hou)鳥(niao)棲息地和遷徙驛站，生存著(zhu)各種鳥(niao)類(lei)87種，其中候(hou)鳥(niao)50種，列(lie)(lie)入國(guo)家一、二級保(bao)(bao)(bao)護(hu)鳥(niao)類(lei)有(you)(you)16種，列(lie)(lie)入IUCN保(bao)(bao)(bao)護(hu)名(ming)錄的(de)(de)有(you)(you)2種，列(lie)(lie)入《瀕(bin)(bin)危野(ye)生動物(wu)國(guo)際貿易(yi)公約》的(de)(de)有(you)(you)8種，列(lie)(lie)入《中國(guo)瀕(bin)(bin)危動物(wu)紅皮書》的(de)(de)有(you)(you)3種。
白尾海雕是大型猛禽，被列(lie)入《世界自然保(bao)護聯盟》（IUCN） 2012年瀕危物(wu)種(zhong)紅色(se)名(ming)錄，屬于(yu)國家一(yi)級保(bao)護動物(wu)。
保護區(qu)還生長(chang)著(zhu)各(ge)類種子(zi)植(zhi)物141種，其中國家重點保護珍稀瀕(bin)危植(zhi)物4種。
敦煌陽關(guan)國(guo)家(jia)級自然保護區(qu)的建立(li)，對積極探索極端(duan)干(gan)旱(han)區(qu)荒(huang)漠(mo)濕地(di)的治理(li)、水環境改善和(he)生物(wu)(wu)多(duo)樣(yang)性(xing)(xing)保護，實現濕地(di)生態環境的重建，對研(yan)究我國(guo)西(xi)部(bu)荒(huang)漠(mo)區(qu)濕地(di)與(yu)荒(huang)漠(mo)復合生態系統(tong)的變遷和(he)演替，保存野生動(dong)(dong)植物(wu)(wu)種質的遺傳多(duo)樣(yang)性(xing)(xing)和(he)棲(qi)息(xi)地(di)，保護和(he)拯救瀕(bin)危物(wu)(wu)種，開展生態學研(yan)究具(ju)有獨(du)特的價值，對甘肅河西(xi)走廊乃至(zhi)中(zhong)國(guo)西(xi)部(bu)的生態安全，莫高窟、月牙泉、陽關(guan)遺址等(deng)著名文化(hua)古跡和(he)自然景觀(guan)的保護，以(yi)及甘、青(qing)、新三省區(qu)交界處生物(wu)(wu)多(duo)樣(yang)性(xing)(xing)保護都有著重大意義。保護區(qu)濕地(di)良好的荒(huang)漠(mo)植被、濕地(di)中(zhong)充足的水源(yuan)和(he)飼料為(wei)黑鸛和(he)鵝喉(hou)羚等(deng)珍稀瀕(bin)危動(dong)(dong)物(wu)(wu)的生存和(he)繁衍提供了(le)保障。
