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同治七年十(shi)一月(yue)三十(shi)日（1869年1月(yue)12日），章(zhang)(zhang)太(tai)炎(yan)出(chu)生于(yu)一個地主(zhu)家庭。章(zhang)(zhang)太(tai)炎(yan)起初跟從外(wai)祖(zu)(zu)父朱有虔（左(zuo)卿(qing)）學習(xi)，自稱：“余十(shi)一歲時，外(wai)祖(zu)(zu)朱左(zuo)卿(qing)授余讀(du)經，偶讀(du)蔣氏《東華錄》曾靜案(an)，外(wai)祖(zu)(zu)謂：‘夷夏之防(fang)，同于(yu)君臣(chen)之義(yi)。’余問：‘前人有談(tan)此語否(fou)？’外(wai)祖(zu)(zu)曰(yue)(yue)：‘王船山、顧亭林已言(yan)之，尤以(yi)王氏之言(yan)為甚。謂‘歷代(dai)亡國，無足輕重，惟(wei)南宋之亡，則衣冠文(wen)物，亦與之俱(ju)亡。’余曰(yue)(yue)：‘明(ming)亡于(yu)清，反不(bu)如亡于(yu)李(li)闖。’外(wai)祖(zu)(zu)曰(yue)(yue)：‘今(jin)不(bu)必作此論，若(ruo)果李(li)闖得明(ming)天下(xia)，闖雖不(bu)善，其子孫未必皆不(bu)善，惟(wei)今(jin)不(bu)必作此論耳。’余之革命思想伏(fu)根(gen)于(yu)此。”
光(guang)緒十(shi)六年（1890年），章太(tai)炎到杭州詁經(jing)精舍學(xue)習，詁經(jing)精舍的(de)主持人是(shi)俞樾，俞樾是(shi)從(cong)顧炎武、戴震、王念孫(sun)、王引之(zhi)等一脈相承下(xia)來的(de)清代著名(ming)樸學(xue)大(da)師，撰有《群經(jing)平議(yi)》、《諸(zhu)子平議(yi)》、《古書疑義舉例》，校正群經(jing)，諸(zhu)子句讀，審(shen)定(ding)文(wen)義，并分析(xi)其特(te)殊文(wen)法與修辭，治學(xue)方法縝(zhen)密，章太(tai)炎受(shou)其影響，埋頭研(yan)究學(xue)問，前后一共有八年之(zhi)久，期間章太(tai)炎收獲頗(po)大(da)。
光(guang)緒二十(shi)年(nian)(nian)（1894年(nian)(nian)），中(zhong)日(ri)甲(jia)午戰爭(zheng)中(zhong)中(zhong)國(guo)(guo)(guo)被日(ri)本侵略(lve)者打敗(bai)，在民族危機(ji)深(shen)重(zhong)的(de)刺激下(xia)，章(zhang)(zhang)太(tai)炎(yan)毅然(ran)走出書(shu)(shu)齋，聽(ting)到康有(you)為(wei)(wei)設立強學(xue)(xue)會(hui)(hui)，“寄(ji)會(hui)(hui)費銀十(shi)六圓入會(hui)(hui)”。并于(yu)光(guang)緒二十(shi)二年(nian)(nian)（1896年(nian)(nian)）年(nian)(nian)末辭別(bie)俞(yu)樾，來(lai)到上(shang)海，擔任《時(shi)務報(bao)》編務。章(zhang)(zhang)太(tai)炎(yan)當時(shi)的(de)辦報(bao)主張是(shi)“馳騁(cheng)百(bai)家”，“引古鑒(jian)(jian)今(jin)”，“證(zheng)今(jin)則(ze)不(bu)為(wei)(wei)巵言，陳(chen)古則(ze)不(bu)觸時(shi)忌”。他在《時(shi)務報(bao)》任職(zhi)不(bu)久(jiu)，文章(zhang)(zhang)也只(zhi)發(fa)(fa)表《論(lun)亞洲宜自(zi)為(wei)(wei)唇齒》和(he)《論(lun)學(xue)(xue)會(hui)(hui)有(you)大益(yi)于(yu)黃(huang)人(ren)亟宜保護》兩(liang)篇。他認(ren)為(wei)(wei)凡是(shi)西方資本主義國(guo)(guo)(guo)家的(de)長(chang)技，都(dou)可(ke)以被中(zhong)國(guo)(guo)(guo)所借鑒(jian)(jian)，并且可(ke)以作為(wei)(wei)改(gai)(gai)變成(cheng)法(fa)的(de)參考，例(li)如舉(ju)辦“有(you)益(yi)于(yu)黃(huang)人(ren)”的(de)學(xue)(xue)會(hui)(hui)。應(ying)(ying)該“修內政(zheng)”，行“新制度”，不(bu)能“惟舊章(zhang)(zhang)之(zhi)守”，而(er)須“發(fa)(fa)憤(fen)為(wei)(wei)天下(xia)雄”。他認(ren)為(wei)(wei)“變郊號，柴社稷，謂(wei)之(zhi)革命；禮秀民，聚俊才(cai)，謂(wei)之(zhi)革政(zheng)。”在當時(shi)的(de)社會(hui)(hui)條件下(xia)，應(ying)(ying)該“以革政(zheng)挽革命”，亦即實(shi)施(shi)政(zheng)治改(gai)(gai)革。與(yu)此同時(shi)，章(zhang)(zhang)太(tai)炎(yan)又編撰《經世報(bao)》、《實(shi)學(xue)(xue)報(bao)》和(he)《譯書(shu)(shu)公會(hui)(hui)報(bao)》。還(huan)于(yu)光(guang)緒二十(shi)四年(nian)(nian)（1898年(nian)(nian)）上(shang)書(shu)(shu)李(li)鴻章(zhang)(zhang)，企求他能把握世界的(de)潮流實(shi)行改(gai)(gai)革。也曾(ceng)跑到武(wu)昌，幫(bang)助張之(zhi)洞辦《正學(xue)(xue)報(bao)》，幻想(xiang)借助他的(de)實(shi)力推動(dong)維新變法(fa)。不(bu)久(jiu)，維新派推動(dong)的(de)百(bai)日(ri)維新夭折(zhe)，章(zhang)(zhang)太(tai)炎(yan)避地臺灣。他對戊(wu)戌六君(jun)子的(de)慘(can)遭殺戮(lu)深(shen)表憤(fen)慨；對康有(you)為(wei)(wei)“內不(bu)容(rong)于(yu)讒(chan)構”而(er)“見詆于(yu)俗儒鄉愿者”為(wei)(wei)之(zhi)解脫；對以慈禧太(tai)后為(wei)(wei)首的(de)頑固派的(de)專制驕橫極為(wei)(wei)仇恨，“討之(zhi)猶可(ke)，況數其罪乎？”經歷維新新政(zheng)的(de)破滅，他的(de)“革政(zheng)”思想(xiang)較(jiao)前又有(you)發(fa)(fa)展。
光緒二十五年(nian)（1899年(nian)）夏天，章(zhang)太(tai)(tai)炎東(dong)渡日本(ben)，在京都、東(dong)京等地為反清做準備，并與(yu)梁啟超(chao)等人修好，之(zhi)后返回上海參與(yu)《亞東(dong)時報(bao)》編務工作。此時章(zhang)太(tai)(tai)炎的排滿觀和古文經立場(chang)日益明(ming)確，在蘇州出版(ban)了(le)其著作《訄書(shu)》的第一版(ban)，由梁啟超(chao)題簽。
光(guang)緒(xu)二十(shi)(shi)六年(nian)(nian)（1900年(nian)(nian)），義(yi)和(he)團運動爆(bao)發(fa)，八國聯軍侵華等相繼(ji)發(fa)生，慈禧太(tai)后等頑固派(pai)(pai)的(de)賣(mai)國原形(xing)暴露無遺，章太(tai)炎(yan)(yan)受到(dao)極大震動，從維新夢中醒(xing)來(lai)。7月，在(zai)上海召開(kai)的(de)中國議(yi)會上，他激烈反對(dui)改(gai)良派(pai)(pai)提(ti)出(chu)的(de)“一(yi)面排滿，一(yi)面勤王”的(de)模糊口號，“宣(xuan)言脫社(she)，割辮與絕(jue)”，撰(zhuan)《解辮發(fa)》以明志。對(dui)過去設想的(de)“客帝(di)”、“分鎮”也進(jin)(jin)行了糾正，說(shuo)是(shi)“余自(zi)戊、己違(wei)難，與尊清者(zhe)游而(er)作《客帝(di)》，飾茍且之心，棄(qi)本崇(chong)教，其(qi)違(wei)于(yu)(yu)形(xing)勢遠矣”。進(jin)(jin)而(er)提(ti)出(chu)：“滿洲弗逐，欲士之愛(ai)國，民(min)之敵愾，不可(ke)得也。浸(jin)微浸(jin)削，亦終(zhong)為歐、美之陪隸(li)已矣。”接(jie)著，章太(tai)炎(yan)(yan)樹(shu)起(qi)反清的(de)旗幟，開(kai)始向(xiang)改(gai)良派(pai)(pai)展(zhan)開(kai)斗爭。光(guang)緒(xu)二十(shi)(shi)七(qi)年(nian)(nian)（1901年(nian)(nian)），章太(tai)炎(yan)(yan)在(zai)東京《國民(min)報》發(fa)表(biao)《正仇滿論》，尖(jian)銳批判梁(liang)啟超(chao)：“梁(liang)子所悲(bei)痛(tong)者(zhe)，革(ge)命耳；所悲(bei)痛(tong)于(yu)(yu)革(ge)命，而(er)思以憲法易之者(zhe)，為其(qi)圣(sheng)明之主耳。”
光緒二(er)十八年(nian)正月（1902年(nian)2月），章太(tai)炎再(zai)次被追捕(bu)，流亡日本(ben)。初住橫(heng)濱，后(hou)入東(dong)京，和孫中(zhong)(zhong)山結識，他(ta)們共同商討推翻清朝之后(hou)的(de)典章制度和中(zhong)(zhong)國的(de)土地賦稅以至建都問(wen)題，《訄(qiu)書(shu)》重印本(ben)《相宅》和《定(ding)版(ban)籍》中(zhong)(zhong)，就(jiu)記錄了(le)(le)他(ta)倆當時(shi)的(de)討論情況。6月，章太(tai)炎返回(hui)祖國，為(wei)(wei)上海廣(guang)智書(shu)局修(xiu)改(gai)(gai)他(ta)的(de)譯(yi)文，曾譯(yi)述日本(ben)岸(an)本(ben)能(neng)武太(tai)所著(zhu)《社會學》。他(ta)還修(xiu)改(gai)(gai)了(le)(le)《訄(qiu)書(shu)》，并(bing)立下(xia)了(le)(le)編(bian)修(xiu)《中(zhong)(zhong)國通史(shi)》的(de)志(zhi)向，認為(wei)(wei)“所貴乎(hu)通史(shi)者(zhe)，固(gu)有二(er)方(fang)(fang)面：一(yi)(yi)方(fang)(fang)以發(fa)明社會政治進化衰微之原理為(wei)(wei)主，則(ze)于典志(zhi)見之；一(yi)(yi)方(fang)(fang)以鼓舞民(min)氣，啟(qi)導方(fang)(fang)來為(wei)(wei)主，則(ze)亦必于紀(ji)傳見之”。
光緒(xu)二十九年二月(yue)（1903年3月(yue)），章太炎到中國(guo)教育會贊(zan)助成立的上(shang)(shang)海愛國(guo)社任教。這時，抗法拒俄運動展(zhan)開(kai)，革(ge)(ge)命(ming)(ming)(ming)(ming)(ming)形(xing)勢(shi)發(fa)展(zhan)，而康有(you)為(wei)卻發(fa)表了(le)《與同學(xue)諸(zhu)子梁啟(qi)超(chao)等論(lun)(lun)印度(du)亡國(guo)由于各省自立書》和《答南北美(mei)洲諸(zhu)華商論(lun)(lun)中國(guo)只可行立憲不(bu)可行革(ge)(ge)命(ming)(ming)(ming)(ming)(ming)書》，反對革(ge)(ge)命(ming)(ming)(ming)(ming)(ming)黨公開(kai)攻(gong)擊滿族統治者(zhe)，以(yi)(yi)為(wei)立憲可以(yi)(yi)避(bi)免革(ge)(ge)命(ming)(ming)(ming)(ming)(ming)造成的慘劇，鼓吹光緒(xu)帝復(fu)辟。章太炎看到后(hou)，公開(kai)批駁康有(you)為(wei)，指出康有(you)為(wei)所謂(wei)的“滿漢不(bu)分，君民同治”，實際(ji)上(shang)(shang)是(shi)“屈心忍志以(yi)(yi)處奴(nu)隸之(zhi)(zhi)(zhi)地”。光緒(xu)帝只是(shi)“未(wei)辨(bian)菽(shu)麥”的“小(xiao)丑”，他當初贊(zan)成變法，不(bu)過是(shi)“保吾權位”，如果(guo)一旦復(fu)辟，必然將中國(guo)引向滅(mie)亡。章太炎贊(zan)美(mei)革(ge)(ge)命(ming)(ming)(ming)(ming)(ming)：“公理之(zhi)(zhi)(zhi)未(wei)明，即以(yi)(yi)革(ge)(ge)命(ming)(ming)(ming)(ming)(ming)明之(zhi)(zhi)(zhi)；舊俗之(zhi)(zhi)(zhi)俱在，即以(yi)(yi)革(ge)(ge)命(ming)(ming)(ming)(ming)(ming)去之(zhi)(zhi)(zhi)。革(ge)(ge)命(ming)(ming)(ming)(ming)(ming)非天雄、大黃之(zhi)(zhi)(zhi)猛(meng)劑，而實補瀉兼備之(zhi)(zhi)(zhi)良藥矣。”他又為(wei)鄒容《革(ge)(ge)命(ming)(ming)(ming)(ming)(ming)軍》撰序，說是(shi)“夫中國(guo)吞噬于逆胡二百六十年矣，宰割(ge)之(zhi)(zhi)(zhi)酷，詐暴之(zhi)(zhi)(zhi)工，人(ren)人(ren)所身受，當無不(bu)昌言革(ge)(ge)命(ming)(ming)(ming)(ming)(ming)”。
光緒三十二年（1906年）6月29日(ri)(ri)，章太(tai)炎出獄，中(zhong)國(guo)同盟(meng)(meng)會(hui)派員至(zhi)滬迎(ying)(ying)章太(tai)炎赴(fu)日(ri)(ri)。他在(zai)(zai)日(ri)(ri)本加(jia)入中(zhong)國(guo)同盟(meng)(meng)會(hui)，主(zhu)編(bian)中(zhong)國(guo)同盟(meng)(meng)會(hui)機關報《民(min)(min)報》。他在(zai)(zai)東京留學生歡迎(ying)(ying)會(hui)上發表演說(shuo)，述“平(ping)生的(de)(de)(de)(de)歷史與近日(ri)(ri)辦事(shi)(shi)(shi)的(de)(de)(de)(de)方法”，認(ren)為(wei)最(zui)緊要的(de)(de)(de)(de)是：“第一(yi)(yi)，是用(yong)宗(zong)教發起信心(xin)，增(zeng)進國(guo)民(min)(min)的(de)(de)(de)(de)道德；第二，是用(yong)國(guo)粹激動(dong)種性，增(zeng)進愛(ai)國(guo)的(de)(de)(de)(de)熱腸。”他說(shuo)：“近來(lai)有(you)一(yi)(yi)種歐化主(zhu)義的(de)(de)(de)(de)人(ren)，總說(shuo)中(zhong)國(guo)人(ren)比西(xi)洋(yang)人(ren)所(suo)差甚遠，所(suo)以自甘(gan)暴棄，說(shuo)中(zhong)國(guo)必定(ding)滅亡，黃種必定(ding)剿絕。因為(wei)他不(bu)(bu)曉得(de)中(zhong)國(guo)的(de)(de)(de)(de)長處(chu)，見得(de)別無可愛(ai)，就把愛(ai)國(guo)愛(ai)種之心(xin)，一(yi)(yi)日(ri)(ri)衰薄一(yi)(yi)日(ri)(ri)。若他曉得(de)，我想就是全無心(xin)肝的(de)(de)(de)(de)人(ren)，那愛(ai)國(guo)愛(ai)種之心(xin)，必定(ding)風(feng)發泉涌，不(bu)(bu)可遏抑(yi)的(de)(de)(de)(de)。”認(ren)為(wei)“古事(shi)(shi)(shi)古跡，都可以動(dong)人(ren)愛(ai)國(guo)的(de)(de)(de)(de)心(xin)思”。章太(tai)炎在(zai)(zai)《民(min)(min)報》上發表了不(bu)(bu)少政論，基本上是宣揚同盟(meng)(meng)會(hui)的(de)(de)(de)(de)革(ge)命綱(gang)領的(de)(de)(de)(de)。在(zai)(zai)《民(min)(min)報一(yi)(yi)周年紀(ji)念(nian)會(hui)祝(zhu)辭(ci)》中(zhong)強(qiang)調：“掃除腥羶(shan)，建立民(min)(min)國(guo)。”《民(min)(min)報一(yi)(yi)周年紀(ji)念(nian)會(hui)演說(shuo)辭(ci)》說(shuo)：“革(ge)命大(da)事(shi)(shi)(shi)，不(bu)(bu)怕不(bu)(bu)成；中(zhong)華(hua)民(min)(min)國(guo)，不(bu)(bu)怕不(bu)(bu)立。”由章太(tai)炎手(shou)撰，以“軍(jun)政府”名義發表的(de)(de)(de)(de)《討滿洲檄》，更明(ming)確指(zhi)出：“自盟(meng)(meng)而后，為(wei)掃除韃虜，恢復中(zhong)華(hua)，建立民(min)(min)國(guo)，平(ping)均地權。有(you)諭(yu)此盟(meng)(meng)，四萬萬人(ren)共擊之。”
章(zhang)太(tai)(tai)炎在(zai)論文中(zhong)強調革命(ming)黨(dang)自身的建設，認(ren)為“優(you)于(yu)(yu)私德(de)(de)者亦(yi)必優(you)于(yu)(yu)公德(de)(de)，薄于(yu)(yu)私德(de)(de)者亦(yi)必薄于(yu)(yu)公德(de)(de)。而無道德(de)(de)者之(zhi)(zhi)(zhi)不(bu)能革命(ming)，較然明矣”。指(zhi)出革命(ming)者必須“確固堅(jian)厲，重然諾，輕死生”，應該做到“知恥”、“重厚(hou)”、“耿介”、“必信”，要(yao)有“革命(ming)之(zhi)(zhi)(zhi)道德(de)(de)”。章(zhang)太(tai)(tai)炎在(zai)論文中(zhong)深刻揭露改良(liang)派“競名死利”、“志在(zai)千祿(lu)”的丑(chou)態。并說：“夫其(qi)所(suo)操技術，豈(qi)謂上(shang)(shang)足(zu)以(yi)(yi)(yi)給當世之(zhi)(zhi)(zhi)用，下足(zu)以(yi)(yi)(yi)成一(yi)家之(zhi)(zhi)(zhi)言耶？汗(han)漫之(zhi)(zhi)(zhi)策論，不(bu)可(ke)以(yi)(yi)(yi)為成文之(zhi)(zhi)(zhi)法；雜博之(zhi)(zhi)(zhi)記誦，不(bu)可(ke)以(yi)(yi)(yi)當說經(jing)之(zhi)(zhi)(zhi)詁；單篇之(zhi)(zhi)(zhi)文筆，不(bu)可(ke)以(yi)(yi)(yi)承(cheng)儒、墨之(zhi)(zhi)(zhi)流(liu)；匿采之(zhi)(zhi)(zhi)華辭，不(bu)可(ke)以(yi)(yi)(yi)備瞽蒙(meng)之(zhi)(zhi)(zhi)頌；淫哇之(zhi)(zhi)(zhi)賦詠，不(bu)可(ke)以(yi)(yi)(yi)瞻國政之(zhi)(zhi)(zhi)違(wei)。既(ji)失其(qi)末，而又不(bu)得(de)其(qi)本，視經(jing)方陶冶(ye)之(zhi)(zhi)(zhi)流(liu)，猶尚弗(fu)及，亦(yi)曰以(yi)(yi)(yi)是嘩(hua)世取(qu)寵而已”，指(zhi)出改良(liang)派的“謀(mou)立憲(xian)”，只能使“豪民得(de)志，苞(bao)苴橫流(liu)，朝(chao)有黨(dang)援，吏(li)依門戶，士習(xi)囂競，民苦騷煩”，表示堅(jian)決反對。他還在(zai)《民報》上(shang)(shang)刊發別人批(pi)駁《新(xin)民叢報》的文章(zhang)。章(zhang)太(tai)(tai)炎在(zai)《民報》上(shang)(shang)發表的文章(zhang)，大都針鋒相對，文字銳利，“真(zhen)是所(suo)向披(pi)靡(mi)，令(ling)人神旺”。
自光緒(xu)三十一年(nian)(nian)(nian)（1905年(nian)(nian)(nian)）起，章太炎(yan)在《國(guo)粹學(xue)(xue)報》上發表若(ruo)干學(xue)(xue)術(shu)文(wen)字(zi)，并在東(dong)京開設國(guo)學(xue)(xue)講(jiang)(jiang)習班，“宏獎光復，不(bu)廢(fei)講(jiang)(jiang)學(xue)(xue)”。此(ci)前，光緒(xu)二十九年(nian)(nian)(nian)（1903年(nian)(nian)(nian)），章太炎(yan)與(yu)(yu)(yu)近(jin)代(dai)古文(wen)經學(xue)(xue)另一重鎮劉(liu)師培定(ding)交，此(ci)后因學(xue)(xue)術(shu)祈向(xiang)相近(jin)而交往日(ri)密，遂發生被劉(liu)師培與(yu)(yu)(yu)妻子何震誣蔑叛變事(shi)件。又(you)(you)與(yu)(yu)(yu)孫中山、汪精衛、黃(huang)興等因《民報》不(bu)合，乃由提倡光復轉入專心(xin)論(lun)學(xue)(xue)，著有(you)(you)《文(wen)始》《新方言》《國(guo)故(gu)(gu)論(lun)衡(heng)》《齊(qi)物論(lun)釋》等。其(qi)中《國(guo)故(gu)(gu)論(lun)衡(heng)》為近(jin)代(dai)學(xue)(xue)術(shu)史上有(you)(you)數之巨制，開辟了漢語(yu)言文(wen)字(zi)學(xue)(xue)、經學(xue)(xue)、文(wen)學(xue)(xue)及哲學(xue)(xue)、心(xin)理學(xue)(xue)的(de)現代(dai)化研究的(de)先河。宣統(tong)元年(nian)(nian)(nian)（1909年(nian)(nian)(nian)）又(you)(you)編有(you)(you)《教育今語(yu)雜(za)志》，撰寫若(ruo)干白話述學(xue)(xue)著作，以普及學(xue)(xue)術(shu)。
宣(xuan)統(tong)三年(nian)（1911年(nian)），武昌起(qi)義勝利(li)之后，章(zhang)太(tai)炎(yan)提出(chu)了“革(ge)命軍起(qi)，革(ge)命黨(dang)消(xiao)”的(de)錯誤口號，主(zhu)(zhu)張解散同盟會(hui)，并和(he)一些立憲黨(dang)人在(zai)一起(qi)，組織(zhi)中(zhong)華(hua)(hua)民國(guo)聯(lian)合會(hui)。民國(guo)元年(nian)（1912年(nian)）1月1日，孫中(zhong)山在(zai)南京就(jiu)任中(zhong)華(hua)(hua)民國(guo)臨時大(da)總(zong)統(tong)，聘任章(zhang)太(tai)炎(yan)為總(zong)統(tong)府樞(shu)密顧問(wen)，他(ta)不愿常駐南京，返回上海(hai)。2月中(zhong)旬，在(zai)討論建都問(wen)題時，章(zhang)太(tai)炎(yan)主(zhu)(zhu)張建都北京，認為“中(zhong)國(guo)本因舊之國(guo)，非新辟之國(guo)，其良法美俗，應(ying)保存者(zhe)則(ze)存留之，不能事事更張也(ye)”。他(ta)依戀舊制(zhi)(zhi)(zhi)度，說“專(zhuan)制(zhi)(zhi)(zhi)非無(wu)良規，共和(he)非無(wu)粃政”，“政治法律，皆依習慣而成”，主(zhu)(zhu)張中(zhong)央“特建都察院”，“限(xian)制(zhi)(zhi)(zhi)元首”，地方“廢省存道(dao)”，而對代議民主(zhu)(zhu)制(zhi)(zhi)(zhi)則(ze)表(biao)示反(fan)對，主(zhu)(zhu)張“限(xian)制(zhi)(zhi)(zhi)財產(chan)”，又以(yi)“奪富者(zhe)之田(tian)以(yi)與貧民”為“大(da)悖乎理”。
南(nan)北議和告成，袁(yuan)世凱上(shang)(shang)臺，章太炎幻想袁(yuan)世凱“厲(li)精法治”，“以厝中夏于泰(tai)山磐石之安”。在用人問題上(shang)(shang)，以為(wei)“同盟(meng)會人材乏絕(jue)，清流不歸(gui)”。反對(dui)“政(zheng)(zheng)黨內閣”，提(ti)出“取(qu)清時南(nan)方督撫有材名者以充閣員之選”。說什么：“漢之良相，即亡(wang)秦之退(tui)官；唐之名臣，即敗隋(sui)之故(gu)吏(li)。”主張“循舊貫”，用“老吏(li)”。將中華民國(guo)聯合會與(yu)一些小政(zheng)(zheng)團合并，改組(zu)為(wei)統(tong)一黨，以后更與(yu)民社(she)等并為(wei)共和黨，推黎元洪(hong)為(wei)理事長。
袁(yuan)(yuan)世凱(kai)給了章(zhang)(zhang)(zhang)太(tai)(tai)炎(yan)一(yi)個總(zong)統府高等顧(gu)問的(de)空銜，不(bu)(bu)久又(you)委(wei)任為東(dong)(dong)三省籌(chou)邊使(shi)(shi)，調出北京。章(zhang)(zhang)(zhang)太(tai)(tai)炎(yan)興(xing)致(zhi)勃勃地跑到東(dong)(dong)北去“興(xing)辦(ban)實(shi)(shi)業(ye)”，設(she)東(dong)(dong)三省籌(chou)邊使(shi)(shi)署(shu)于長(chang)(chang)春，擬《東(dong)(dong)三省實(shi)(shi)業(ye)計劃書(shu)》，提出“設(she)立三省銀行，以圓易吊，使(shi)(shi)民易知”，并(bing)鑄造金(jin)幣。“欲鑄金(jin)幣，又(you)不(bu)(bu)可不(bu)(bu)預浚金(jin)源，非(fei)開辦(ban)金(jin)礦，收買金(jin)砂(sha)，不(bu)(bu)足以供(gong)鼓(gu)鑄。又(you)請開浚松花江、遼河(he)，去其淤梗，以利交通”。還擬“組織(zhi)報館”，“設(she)會研究”。但沒有多久，宋(song)教(jiao)仁遇(yu)刺，血的(de)教(jiao)訓使(shi)(shi)他(ta)(ta)猛醒過來(lai)，他(ta)(ta)沉痛地《挽宋(song)教(jiao)仁》：“愿(yuan)君(jun)化(hua)彗(hui)孛；為我掃幽(you)燕”，開始(shi)對袁(yuan)(yuan)世凱(kai)不(bu)(bu)信任了。4月，章(zhang)(zhang)(zhang)太(tai)(tai)炎(yan)托事南行。5月，他(ta)(ta)又(you)親赴武昌，拜(bai)謁了黎元洪(hong)，在湖北致(zhi)電袁(yuan)(yuan)世凱(kai)，請求免除梁(liang)士詒、陳(chen)宧(yi)、段(duan)芝貴、趙秉(bing)鈞“四兇(xiong)”的(de)職位。接著，由武漢到了北京，袁(yuan)(yuan)世凱(kai)設(she)法籠絡章(zhang)(zhang)(zhang)太(tai)(tai)炎(yan)。5月25日發令“章(zhang)(zhang)(zhang)炳麟(lin)授以勛二位”，“冀以歆動”。6月4日，章(zhang)(zhang)(zhang)太(tai)(tai)炎(yan)離京來(lai)滬。而他(ta)(ta)早先提議在東(dong)(dong)北籌(chou)設(she)實(shi)(shi)業(ye)銀行的(de)借款，財政部長(chang)(chang)梁(liang)士詒不(bu)(bu)肯蓋章(zhang)(zhang)(zhang)，章(zhang)(zhang)(zhang)太(tai)(tai)炎(yan)“實(shi)(shi)業(ye)計劃”落(luo)空，感到“大抵政府之(zhi)與我輩，忌疾甚(shen)深，罵(ma)亦阻撓，不(bu)(bu)罵(ma)亦阻撓”，于是(shi)決計“辭差”，“奉身而退”。
民國(guo)(guo)二(er)年（1913年）4月(yue)，章太(tai)(tai)炎(yan)(yan)(yan)從長春(chun)返回(hui)上海(hai)。7月(yue)，孫(sun)中(zhong)(zhong)山(shan)(shan)、黃(huang)(huang)興舉兵(bing)武力討袁(yuan)(yuan)，章太(tai)(tai)炎(yan)(yan)(yan)卻不(bu)(bu)(bu)信賴，說什么“討袁(yuan)(yuan)者亦非(fei)其人(ren)”。他(ta)(ta)既罵袁(yuan)(yuan)世凱“用(yong)心陰摯，正與(yu)西(xi)太(tai)(tai)后大同”，又說孫(sun)中(zhong)(zhong)山(shan)(shan)“與(yu)項城一丘之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)貉”。“謂(wei)宜雙退袁(yuan)(yuan)與(yu)孫(sun)、黃(huang)(huang)，改(gai)建(jian)賢哲，仆則承命”。以為(wei)(wei)“若為(wei)(wei)久遠計(ji)，凡一政黨，非(fei)有(you)實業(ye)為(wei)(wei)中(zhong)(zhong)堅，即(ji)(ji)有(you)俠士(shi)為(wei)(wei)后應(ying)，無(wu)此(ci)即(ji)(ji)不(bu)(bu)(bu)足以自樹。非(fei)實業(ye)則費用(yong)不(bu)(bu)(bu)給，而政府(fu)得以利用(yong)之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)矣；非(fei)俠士(shi)則氣勢(shi)不(bu)(bu)(bu)壯(zhuang)，而政府(fu)得以威喝之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)矣”。以為(wei)(wei)總統改(gai)選(xuan)，“大抵仍(reng)宜推舉黃(huang)(huang)陂，必不(bu)(bu)(bu)肯任，然后求之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)西(xi)林(lin)”。“黃(huang)(huang)陂之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)廉讓，可望責任內閣；西(xi)林(lin)之(zhi)(zhi)(zhi)(zhi)果毅，可望廓(kuo)清(qing)貪邪”。黎(li)元洪（黃(huang)(huang)陂）也好，岑春(chun)煊（西(xi)林(lin)）也好，都(dou)是清(qing)朝舊官僚，民國(guo)(guo)新軍閥，章太(tai)(tai)炎(yan)(yan)(yan)對這(zhe)些(xie)人(ren)寄以厚(hou)望，他(ta)(ta)已彷徨歧途了(le)。
6月，章(zhang)(zhang)太炎與湯國梨結婚。8月，章(zhang)(zhang)太炎“冒(mao)危入京師(shi)”，一方(fang)面看到“京邑崎嶇，道(dao)路以目”，以為(wei)“吾雖微(wei)末，以一身攖暴人之刃(ren)，使天下(xia)皆曉(xiao)然于彼之兇戾(li)，亦何惜此(ci)孱(chan)形為(wei)”，表示不畏(wei)強暴，敢臨(lin)虎穴(xue)；另(ling)一方(fang)面又以為(wei)“共(gong)和黨(dang)勢漸擴張，此(ci)為(wei)可熹”，“連日議員入黨(dang)者(zhe)，已增三(san)十人矣(yi)，驥(ji)老(lao)伏櫪，志在千里，況吾猶未老(lao)耶？”但是，袁世凱對(dui)章(zhang)(zhang)太炎還(huan)是不肯放松，對(dui)他加緊(jin)迫(po)害，把他軟(ruan)禁起來(lai)，梁士詒、趙秉鈞(jun)等還(huan)欲“捏造證(zheng)據，置(zhi)章(zhang)(zhang)于死”。
民(min)國(guo)三(san)年(nian)（1914年(nian)）1月，章(zhang)太(tai)炎欲(yu)乘車離京，為軍警(jing)所阻(zu)。7日，“以大(da)勛章(zhang)作扇墜，臨總統府(fu)之(zhi)(zhi)門(men)，大(da)詬(gou)袁(yuan)(yuan)世(shi)凱之(zhi)(zhi)包(bao)藏禍心”，仍(reng)被監禁(jin)。曾決意絕(jue)食，“以死(si)(si)爭(zheng)之(zhi)(zhi)”，自云(yun)：“不死(si)(si)于清(qing)廷購捕之(zhi)(zhi)時，而(er)死(si)(si)于民(min)國(guo)告成之(zhi)(zhi)后，吾何言哉！”直到民(min)國(guo)五年(nian)（1916年(nian)）袁(yuan)(yuan)世(shi)凱死(si)(si)后，才被釋(shi)放。在監禁(jin)期間，編(bian)成《章(zhang)氏叢書》初編(bian)。
民(min)國(guo)五年(nian)(nian)（1916年(nian)(nian)）6月，章(zhang)(zhang)(zhang)太(tai)炎(yan)由(you)北(bei)京南返。這時，孫(sun)(sun)中(zhong)山(shan)也在上海，曾(ceng)兩電黎元洪規復約(yue)法(fa)，尊重(zhong)國(guo)會(hui)；章(zhang)(zhang)(zhang)太(tai)炎(yan)也認(ren)為“約(yue)法(fa)、國(guo)會(hui)，本民(min)國(guo)固有之(zhi)物，為袁氏所摧殘”，主(zhu)張維護。此后(hou)，他多次和孫(sun)(sun)中(zhong)山(shan)一起參加會(hui)議，基本主(zhu)張與孫(sun)(sun)中(zhong)山(shan)尚相(xiang)契合。8月，章(zhang)(zhang)(zhang)太(tai)炎(yan)南赴(fu)肇慶，去(qu)看望岑春煊，更出游南洋群島，一直(zhi)到年(nian)(nian)末才回國(guo)。孫(sun)(sun)中(zhong)山(shan)致電黎元洪，認(ren)為章(zhang)(zhang)(zhang)太(tai)炎(yan)“碩學卓識，不(bu)畏強御，古之(zhi)良史，無以過之(zhi)，為事擇人，竊謂最當”，推舉(ju)章(zhang)(zhang)(zhang)為國(guo)史館長。
民(min)國(guo)(guo)六年（1917年）3月，段祺(qi)瑞召集督(du)軍(jun)團在北(bei)京開(kai)會，商(shang)討(tao)對德宣戰(zhan)。5月7日(ri)，國(guo)(guo)會討(tao)論參戰(zhan)案；10日(ri)，段祺(qi)瑞組織“公民(min)請愿(yuan)團”等(deng)，包(bao)圍國(guo)(guo)會，毆(ou)辱議員。章(zhang)太炎和孫(sun)中山兩次致(zhi)(zhi)電(dian)(dian)黎元洪，要求嚴懲“偽公民(min)犯法亂紀之(zhi)(zhi)人(ren)”，“嚴懲暴徒主名(ming)”，“勿令勢要從旁(pang)掣肘”。6月7日(ri)，張勛率軍(jun)北(bei)上，與(yu)段派(pai)集議，電(dian)(dian)黎“調停須先解(jie)散(san)國(guo)(guo)會”。孫(sun)、章(zhang)聯電(dian)(dian)陸榮廷等(deng)南方各省督(du)軍(jun)、省長，指出：“調停戰(zhan)事之(zhi)(zhi)人(ren)，即主張復辟之(zhi)(zhi)人(ren)；擁護(hu)元首之(zhi)(zhi)人(ren)，即主張廢立之(zhi)(zhi)人(ren)。”“叛人(ren)秉政，則(ze)共和遺民(min)必無(wu)噍類(lei)”。又聯名(ming)致(zhi)(zhi)電(dian)(dian)陳炯明：“國(guo)(guo)會為民(min)國(guo)(guo)之(zhi)(zhi)命脈，調和乃借寇之(zhi)(zhi)資糧(liang)”，“今者群盜鴟張，叛形(xing)已著，黃陂與(yu)之(zhi)(zhi)講解(jie)，實(shi)同降伏(fu)”。
7月1日，張勛(xun)復辟(pi)(pi)。3日，章太炎(yan)與海軍(jun)(jun)(jun)總長程璧光(guang)等在孫(sun)中山(shan)的住處秘(mi)密商議(yi)，籌劃反對張勛(xun)的復辟(pi)(pi)舉(ju)(ju)動(dong)。接(jie)著，與孫(sun)中山(shan)、廖仲愷(kai)、朱執信、何香(xiang)凝乘海琛艦(jian)由(you)上海啟程赴(fu)廣州，于7月17日抵粵。當有人(ren)(ren)詢以討(tao)逆計劃時，章太炎(yan)即(ji)(ji)答以：“余(yu)此(ci)次偕孫(sun)中山(shan)來粵，所抱之希望頗(po)大”，“討(tao)逆之舉(ju)(ju)，即(ji)(ji)為護法而(er)起，惟不(bu)違(wei)法之人(ren)(ren)而(er)后(hou)可以討(tao)逆”。永豐、同(tong)安(an)、豫(yu)章三艦(jian)抵達黃埔，孫(sun)、章一起前往(wang)迎迓。廣東各界開歡迎海軍(jun)(jun)(jun)大會(hui)，孫(sun)中山(shan)、程璧光(guang)到(dao)會(hui)，章太炎(yan)亦(yi)參加。9月1日，國民非常會(hui)議(yi)選舉(ju)(ju)孫(sun)中山(shan)為中華民國軍(jun)(jun)(jun)政府(fu)(fu)大元帥，章太炎(yan)任護法軍(jun)(jun)(jun)政府(fu)(fu)秘(mi)書(shu)長，《大元帥就(jiu)職宣(xuan)言》就(jiu)是章太炎(yan)起草的。《宣(xuan)言》中說：“民國根本，掃地無余(yu)，猶幸共和(he)大義，浹于人(ren)(ren)心(xin)，舉(ju)(ju)國同(tong)聲，誓(shi)(shi)殲(jian)元惡(e)”，誓(shi)(shi)“與天下共擊破(po)壞共和(he)者”。此(ci)后(hou)，因(yin)護法軍(jun)(jun)(jun)政府(fu)(fu)中派系斗爭激烈(lie)，章“欲西行”，孫(sun)中山(shan)勸以“不(bu)當先(xian)去以失(shi)人(ren)(ren)望”，章太炎(yan)表示愿為軍(jun)(jun)(jun)政府(fu)(fu)爭取外援，到(dao)云南聯絡唐(tang)(tang)繼(ji)(ji)堯(yao)。當他抵達昆明后(hou)，多次向唐(tang)(tang)繼(ji)(ji)堯(yao)進言，促唐(tang)(tang)繼(ji)(ji)堯(yao)東下，但唐(tang)(tang)繼(ji)(ji)堯(yao)始終是托故不(bu)出(chu)。
民(min)國八年(nian)(nian)（1919年(nian)(nian)），五四運動爆(bao)發，工人革命運動日(ri)漸發展，章太(tai)炎(yan)卻由反(fan)(fan)對(dui)軍(jun)閥割據逐漸演變為贊(zan)成軍(jun)閥割據。民(min)國九年(nian)(nian)（1920年(nian)(nian)）11月，湖南(nan)通電湘省(sheng)(sheng)自(zi)治(zhi)，章太(tai)炎(yan)隨即在(zai)北京《益(yi)世報》發表《聯省(sheng)(sheng)自(zi)治(zhi)虛置(zhi)政(zheng)(zheng)府(fu)議(yi)》，認為宜虛置(zhi)中(zhong)央(yang)政(zheng)(zheng)府(fu)，軍(jun)政(zheng)(zheng)則分于各省(sheng)(sheng)督軍(jun)。接著，又主張(zhang)使地方權重而中(zhong)央(yang)權輕，各省(sheng)(sheng)自(zi)治(zhi)為第(di)一(yi)步，聯省(sheng)(sheng)自(zi)治(zhi)為第(di)二步，聯省(sheng)(sheng)政(zheng)(zheng)府(fu)為第(di)三步，還必(bi)以本省(sheng)(sheng)人充軍(jun)民(min)長官(guan)。這(zhe)種(zhong)聯省(sheng)(sheng)自(zi)治(zhi)說，和孫中(zhong)山的統一(yi)主張(zhang)背道(dao)而馳。民(min)國十年(nian)(nian)（1921年(nian)(nian)）5月，孫中(zhong)山在(zai)廣(guang)州(zhou)就(jiu)任非(fei)常大總(zong)統職(zhi)，章太(tai)炎(yan)以為非(fei)法，并以“聯合自(zi)治(zhi)不可(ke)反(fan)(fan)對(dui)為獻”。
民國(guo)(guo)(guo)十二年（1923年）1月，孫中(zhong)(zhong)(zhong)山(shan)在(zai)上海發表《和平統一(yi)宣(xuan)(xuan)言》，章(zhang)(zhang)太(tai)炎(yan)以(yi)為“統一(yi)利害，久(jiu)處南方者自(zi)知，若謂借此以(yi)緩最高問題(ti)，則亦非(fei)計”。次年1月，中(zhong)(zhong)(zhong)國(guo)(guo)(guo)國(guo)(guo)(guo)民黨第(di)(di)一(yi)次全(quan)國(guo)(guo)(guo)代表大(da)會在(zai)廣州召開，通(tong)過了《中(zhong)(zhong)(zhong)國(guo)(guo)(guo)國(guo)(guo)(guo)民黨第(di)(di)一(yi)次全(quan)國(guo)(guo)(guo)代表大(da)會宣(xuan)(xuan)言》，接受(shou)了中(zhong)(zhong)(zhong)國(guo)(guo)(guo)共產(chan)黨所(suo)提出的(de)(de)反(fan)帝反(fan)封建的(de)(de)主張，分析和批判了當時社會上流行的(de)(de)各(ge)種錯誤的(de)(de)、反(fan)動的(de)(de)政(zheng)治(zhi)流派(pai)，包括“聯(lian)省(sheng)自(zi)治(zhi)派(pai)”，宣(xuan)(xuan)告取(qu)消不平等(deng)條約；孫中(zhong)(zhong)(zhong)山(shan)又系統講述了三民主義(yi)。10日，決定(ding)應(ying)馮(feng)玉(yu)祥的(de)(de)電邀，“即日北上”。章(zhang)(zhang)太(tai)炎(yan)對(dui)改組后的(de)(de)中(zhong)(zhong)(zhong)國(guo)(guo)(guo)國(guo)(guo)(guo)民黨表示不滿，在(zai)國(guo)(guo)(guo)民黨右派(pai)馮(feng)玉(yu)祥自(zi)由等(deng)的(de)(de)慫恿下，發出《護黨救國(guo)(guo)(guo)宣(xuan)(xuan)言》，“冀以(yi)同(tong)盟舊人，重行集合團(tuan)體(ti)”。不久(jiu)，馮(feng)玉(yu)祥自(zi)由組織中(zhong)(zhong)(zhong)國(guo)(guo)(guo)國(guo)(guo)(guo)民黨同(tong)志俱(ju)樂(le)部，章(zhang)(zhang)太(tai)炎(yan)也組織了辛(xin)亥革命同(tong)志俱(ju)樂(le)部，背離(li)孫中(zhong)(zhong)(zhong)山(shan)，反(fan)對(dui)共產(chan)黨。
民國十四年（1925年），“五卅(sa)運動”發生(sheng)，章太炎發出《為上海英(ying)租界(jie)巡捕慘(can)殺學(xue)生(sheng)之(zhi)通電》。“以(yi)為英(ying)捕而不治罪(zui)，固不足(zu)以(yi)肅刑章；英(ying)捕而果治罪(zui)，亦(yi)未必足(zu)以(yi)防后患。惟有責成外交當局，迅速(su)收(shou)回(hui)租界(jie)市政，庶幾一勞永逸，民慶再生(sheng)”。
民(min)(min)國(guo)(guo)(guo)(guo)十(shi)六年(nian)（1927年(nian)），章(zhang)太炎(yan)(yan)(yan)賦(fu)詩自(zi)述：“見說(shuo)興亡事(shi)，拿舟望五(wu)湖”。晚(wan)年(nian)在(zai)蘇州講學(xue)，組織國(guo)(guo)(guo)(guo)學(xue)會，欲“甄明學(xue)術，發(fa)揚國(guo)(guo)(guo)(guo)光”。民(min)(min)國(guo)(guo)(guo)(guo)二(er)(er)(er)十(shi)二(er)(er)(er)年(nian)（1933年(nian)），刻《章(zhang)氏叢書續編(bian)》于(yu)北平，所(suo)收不(bu)(bu)多(duo)，而(er)(er)更純謹，且不(bu)(bu)取舊作(zuo)，當然(ran)也(ye)無斗爭(zheng)之作(zuo)，先生遂身衣學(xue)術之華袞，粹然(ran)成(cheng)為儒宗”。但是，當帝國(guo)(guo)(guo)(guo)主(zhu)義(yi)蹂躪中國(guo)(guo)(guo)(guo)，中華民(min)(min)族(zu)災難深重的時候，章(zhang)太炎(yan)(yan)(yan)起來(lai)譴責國(guo)(guo)(guo)(guo)民(min)(min)黨(dang)“怯于(yu)御亂而(er)(er)勇于(yu)內爭(zheng)”。民(min)(min)國(guo)(guo)(guo)(guo)二(er)(er)(er)十(shi)一(yi)年(nian)（1932年(nian)），北上見張(zhang)學(xue)良；次年(nian)，又(you)與馬相伯(bo)等聯合發(fa)表“二(er)(er)(er)老宣言(yan)”、“三老宣言(yan)”：“對于(yu)當前日(ri)本(ben)之侵略暴(bao)行(xing)，不(bu)(bu)僅作(zuo)消極(ji)之抵抗，同時更應動(dong)員全民(min)(min)族(zu)積極(ji)收復失地、根本(ben)消滅偽國(guo)(guo)(guo)(guo)”，呼吁抗日(ri)。民(min)(min)國(guo)(guo)(guo)(guo)二(er)(er)(er)十(shi)四年(nian)（1935年(nian)），一(yi)二(er)(er)(er)九運動(dong)發(fa)生，宋哲元進(jin)行(xing)壓制。章(zhang)太炎(yan)(yan)(yan)致(zhi)電宋哲元：“學(xue)生請愿(yuan)，事(shi)出公(gong)誠，縱有加入共(gong)黨(dang)者，但問今(jin)之主(zhu)張(zhang)何(he)如，何(he)論其平素。”
12月(yue)24日，上(shang)海(hai)學生(sheng)北(bei)(bei)上(shang)請(qing)愿(yuan)，國(guo)(guo)民(min)黨加(jia)以(yi)(yi)阻撓，章(zhang)太炎(yan)(yan)“對學生(sheng)愛國(guo)(guo)運動深(shen)表(biao)同(tong)情。但(dan)認(ren)政府當(dang)局，應(ying)善為處(chu)理，不應(ying)貿然(ran)加(jia)以(yi)(yi)共(gong)產(chan)頭銜，武力(li)制止”。請(qing)愿(yuan)學生(sheng)經過蘇州時，又(you)“派(pai)代表(biao)慰(wei)勞，并囑(zhu)縣(xian)長(chang)饋食”。他“瞻顧民(min)族之(zhi)前途，輒(zhe)中(zhong)心忉怛而未能自己”，臨(lin)終前，在(zai)(zai)《答友(you)人書》中(zhong)還說(shuo)：“北(bei)(bei)平既急，縱令勉力(li)支持，察省(sheng)必難兼(jian)顧。蓋非常之(zhi)時，必以(yi)(yi)非常之(zhi)事應(ying)之(zhi)。令共(gong)黨之(zhi)在(zai)(zai)晉北(bei)(bei)者(zhe)，其意不過欲北(bei)(bei)據河套，與蘇俄通聲勢耳。此(ci)輩雖多狙詐，然(ran)其對于日軍(jun)，必不肯俯首馴伏明(ming)甚”。盡管章(zhang)太炎(yan)(yan)不可能對共(gong)產(chan)黨有真正認(ren)識，但(dan)他對共(gong)產(chan)黨的(de)(de)堅持抗戰、國(guo)(guo)民(min)黨的(de)(de)“不抵抗主(zhu)義”還是覺察的(de)(de)。盡管章(zhang)太炎(yan)(yan)晚年(nian)(nian)的(de)(de)行為也(ye)有使人失望之(zhi)處(chu)，卻仍保(bao)持了愛國(guo)(guo)主(zhu)義晚節。民(min)國(guo)(guo)二(er)十五年(nian)(nian)（1936年(nian)(nian)）6月(yue)14日，章(zhang)太炎(yan)(yan)病逝。
《章氏(shi)叢書》，1915年右文社鉛印(yin)本(ben)，1919年浙江圖書館(guan)木刻(ke)本(ben)，1924年上海古書流通處木刻(ke)本(ben)。
《章氏(shi)叢書(shu)續編》，北平(ping)1933年。
《章(zhang)氏叢書三編》，1939年章(zhang)氏國學講習會(hui)鉛印本(ben)。
《章(zhang)太炎全集(ji)(ji)》1-8集(ji)(ji)（尚未出(chu)完），上海人民(min)出(chu)版社，1980-94年點校(xiao)本(ben)。
《國學講習會略(lve)說》，1906年東(dong)京秀(xiu)光(guang)社。
《國故論衡》，1910年(nian)東京秀光社本(ben)(ben)，叢書增訂(ding)本(ben)(ben)。陳平原點校(xiao)本(ben)(ben)，朱維(wei)錚點校(xiao)本(ben)(ben)（《全集》第9集，對照本(ben)(ben)）。
《國學(xue)概論》，曹聚仁筆記本(ben)（又有張冥飛(fei)本(ben)，劣）。1922年泰(tai)東圖書館(guan)排印本(ben)。
《菿漢(han)三言》，虞云國校點，遼(liao)寧(ning)教(jiao)育(yu)出版社。
《國學略說》，涂小馬校點，上海文藝出版(ban)社。
《章炳麟論學(xue)集》，北京師(shi)范大(da)學(xue)出(chu)版社，1982年。
《章太炎(yan)書(shu)信集》，馬勇(yong)編。
《章太(tai)炎(yan)的白話文》，1921年(nian)泰(tai)東(dong)圖書館排印本。
《章太炎政論選集》，湯志鈞編于1961年，中華書(shu)局，1977年點(dian)校本。
《章太(tai)炎(yan)說文解字授課筆記》，朱希祖、錢玄(xuan)同、周樹人(ren)筆記，王寧(ning)整理(li)抄錄，影印謄(teng)鈔本，中華書局，2008年11月。
《太炎先生自定年(nian)譜》，1928年(nian)撰（同(tong)治七(qi)年(nian)至民國十一年(nian)），手稿本(ben)，章氏國學講習會刪改排印本(ben)。1986年(nian)上(shang)海書店影印本(ben)。
《章太(tai)炎年(nian)(nian)譜長編》，湯(tang)志鈞編，中華書局(ju)，1979年(nian)(nian)。
《章太炎年譜摭遺》，謝櫻寧編，中國(guo)社會科(ke)學出版社，1987年。
《章(zhang)太炎(yan)學術年譜(pu)》，姚奠中、董國炎(yan)編，山(shan)西(xi)古籍出版社(she)，1993年。
《自述學術次第》，學術自述，1913年。
《菿漢微言》末條，1915年。
諸祖耿(geng)《記本(ben)師章公自述(shu)治學之功夫及志向》，1933年。
《國故論衡疏證》，龐俊注，1940年華西大學鉛印本(ben)。僅(jin)含中、下卷(juan)；郭誠(cheng)永補注上卷(juan)，北京中華書(shu)局2008年全(quan)排印本(ben)。
《齊(qi)物論(lun)釋注(zhu)(zhu)》，繆篆注(zhu)(zhu)，油印本。未見(jian)。《齊(qi)物論(lun)釋訓(xun)注(zhu)(zhu)》，荒(huang)木見(jian)悟(wu)注(zhu)(zhu)，九州大學文(wen)學部哲學研究會《哲學年報》29-31。未見(jian)。
《章太炎選(xuan)集》（注(zhu)釋本），朱維錚、姜義華(hua)注(zhu)，上海(hai)人民出(chu)版(ban)社，1981年(nian)。
《訄書詳注(zhu)》，徐復注(zhu)，上海(hai)古籍出(chu)版社，2000年。注(zhu)名物。
《文學總略注》，程千帆(fan)《文論(lun)十(shi)箋》，朱東(dong)潤《中國(guo)歷(li)代文論(lun)選》。
英國斯賓塞爾(er)（Herbert Spencer）著，曾廣銓(quan)、章太炎譯(yi)《斯賓塞爾(er)文(wen)集》，上(shang)海《昌(chang)言報(bao)》第1至7本(ben)，1898年。
日本岸本能(neng)武太著、章太炎譯《社會學(xue)》，上海廣智(zhi)書局，1902年鉛(qian)印本。
章太炎的主筆有(you)《時務報(bao)(bao)(bao)(bao)(bao)》、《昌言報(bao)(bao)(bao)(bao)(bao)》、《經世(shi)報(bao)(bao)(bao)(bao)(bao)》、《實學(xue)報(bao)(bao)(bao)(bao)(bao)》、《譯書(shu)公會(hui)報(bao)(bao)(bao)(bao)(bao)》、《亞(ya)東時報(bao)(bao)(bao)(bao)(bao)》、《臺灣日日新報(bao)(bao)(bao)(bao)(bao)》、《民報(bao)(bao)(bao)(bao)(bao)》、《國粹(cui)學(xue)報(bao)(bao)(bao)(bao)(bao)》、《教(jiao)育今(jin)語雜志》、《大共和日報(bao)(bao)(bao)(bao)(bao)》、《華國》、《制言》等。
章氏的(de)思想(xiang)受到(dao)多(duo)方影響，因為(wei)(wei)變化的(de)歷(li)程(cheng)相當繁復，依其《菿(dao)漢微言(yan)》中(zhong)的(de)自述，是以(yi)“始則轉(zhuan)俗(su)成(cheng)真，終則回真向(xiang)俗(su)”十二字予(yu)以(yi)歸結(jie)。大抵(di)而(er)言(yan)可以(yi)光緒二十四年(nian)（1908年(nian)）著(zhu)成(cheng)《齊物論(lun)釋》為(wei)(wei)界。在此之(zhi)前(qian)，章氏先習樸學(xue)(xue)(xue)、諸子(zi)學(xue)(xue)(xue)以(yi)及西方進(jin)化論(lun)和社會(hui)學(xue)(xue)(xue)，在因蘇報案入獄(yu)之(zhi)后，則改習法相宗，而(er)后思想(xiang)便以(yi)唯識學(xue)(xue)(xue)為(wei)(wei)尚，認為(wei)(wei)先秦諸子(zi)之(zhi)學(xue)(xue)(xue)皆不足比擬，固(gu)可謂“轉(zhuan)俗(su)成(cheng)真”。
自《齊物(wu)論釋》著(zhu)成之后，章太(tai)炎(yan)(yan)因(yin)齊物(wu)思(si)(si)想(xiang)的(de)(de)啟示，不再僅以(yi)唯(wei)(wei)識為唯(wei)(wei)一(yi)標準，轉而認為凡“外(wai)能利物(wu)，內以(yi)遣憂(you)”之學(xue)(xue)皆有價值，開始對古今(jin)中(zhong)外(wai)的(de)(de)學(xue)(xue)術思(si)(si)想(xiang)進(jin)行重(zhong)估。即進(jin)入“回(hui)真(zhen)向俗”的(de)(de)境界。形成章太(tai)炎(yan)(yan)思(si)(si)想(xiang)的(de)(de)背景主要來自四(si)個(ge)淵源(yuan)：一(yi)為受乾嘉(jia)學(xue)(xue)派考證學(xue)(xue)的(de)(de)影(ying)響，講(jiang)求客觀實證；二為跟隨(sui)晚清(qing)諸子學(xue)(xue)興(xing)起的(de)(de)潮流(liu)，對荀(xun)子、莊(zhuang)子、老子三家思(si)(si)想(xiang)加(jia)以(yi)揄揚，尊(zun)子貶孔；三為受到嚴復的(de)(de)影(ying)響，在其(qi)(qi)早(zao)年的(de)(de)文章中(zhong)尤其(qi)(qi)多(duo)以(yi)進(jin)化(hua)論作為理(li)論架構；四(si)為佛(fo)學(xue)(xue)，尤其(qi)(qi)是佛(fo)學(xue)(xue)中(zhong)的(de)(de)唯(wei)(wei)識論，是章氏后期思(si)(si)想(xiang)的(de)(de)支(zhi)柱，使其(qi)(qi)思(si)(si)想(xiang)體系(xi)中(zhong)充滿個(ge)體主義、相(xiang)對主義的(de)(de)色彩。除了(le)這四(si)大(da)淵源(yuan)外(wai)，顧炎(yan)(yan)武、王夫之的(de)(de)民族思(si)(si)想(xiang)，章學(xue)(xue)誠、戴震(zhen)、孫(sun)詒讓等人的(de)(de)思(si)(si)想(xiang)也對章太(tai)炎(yan)(yan)具(ju)有相(xiang)當的(de)(de)影(ying)響力。
戊(wu)戌變法之后(hou)，章(zhang)太炎(yan)既對(dui)清朝(chao)統(tong)治(zhi)不滿(man)，又同情康(kang)、梁；既孕有民族(zu)(zu)思想(xiang)，又沒有轉向(xiang)(xiang)革(ge)命。他提(ti)出(chu)了“客帝(di)”和“分鎮(zhen)”的(de)課題，認為(wei)滿(man)洲貴(gui)族(zu)(zu)，是客帝(di)；中國(guo)的(de)“共主(zhu)”應(ying)為(wei)“仲尼之世胄”。只(zhi)要(yao)清朝(chao)皇帝(di)承認過去民族(zu)(zu)壓迫的(de)錯誤，擁護孔子(zi)后(hou)裔，做“虛(xu)君”，自(zi)己退居為(wei)齊桓公、晉文公般的(de)霸主(zhu)，發憤自(zi)強，那么反滿(man)情緒(xu)可(ke)以(yi)(yi)平息(xi)，可(ke)以(yi)(yi)防止“逐加于(yu)滿(man)人，而(er)(er)(er)地(di)割于(yu)白人”。“分鎮(zhen)”也是章(zhang)太炎(yan)在外(wai)國(guo)侵略、清政(zheng)腐朽(xiu)的(de)情況下(xia)提(ti)出(chu)的(de)一(yi)種(zhong)改(gai)良設想(xiang)。認為(wei)政(zheng)治(zhi)危急(ji)之際，“猶賴有數鎮(zhen)稍自(zi)奮(fen)起，足以(yi)(yi)扶危而(er)(er)(er)定傾”。因此(ci)，不能削弱藩(fan)(fan)鎮(zhen)，而(er)(er)(er)“甘心(xin)于(yu)白種(zhong)之陵籍”。藩(fan)(fan)鎮(zhen)和立憲政(zheng)并不矛(mao)盾。“板(ban)蕩之世，非得(de)藩(fan)(fan)鎮(zhen)以(yi)(yi)尊攘，則憲政(zheng)不立”。他舉(ju)明治(zhi)維(wei)新為(wei)例，“若皇德(de)貞(zhen)觀，廓夷歸(gui)章(zhang)，示民版法，陶冶(ye)天下(xia)，而(er)(er)(er)歸(gui)之一(yi)憲，藩(fan)(fan)鎮(zhen)將奔走趨令，如日(ri)本(ben)之薩、長二藩(fan)(fan)，始于(yu)建功，而(er)(er)(er)終于(yu)納土，何(he)惠自(zi)擅(shan)？”此(ci)后(hou)，進(jin)而(er)(er)(er)指出(chu)：“瓜分而(er)(er)(er)授(shou)之外(wai)人，孰與(yu)瓜分而(er)(er)(er)授(shou)之方鎮(zhen)。”他反對(dui)滿(man)洲貴(gui)族(zu)(zu)統(tong)治(zhi)的(de)喪權辱國(guo)，而(er)(er)(er)對(dui)漢族(zu)(zu)地(di)主(zhu)階級還(huan)存幻想(xiang)。他向(xiang)(xiang)往(wang)的(de)還(huan)是明治(zhi)維(wei)新式的(de)“革(ge)政(zheng)”。在旅(lv)臺期間(jian)，他曾將所寫論文匯成《訄書》。光緒(xu)二十五年5月，由基隆去日(ri)本(ben)，7月下(xia)旬，由日(ri)返國(guo)。
章太炎認(ren)為共(gong)(gong)(gong)和(he)政(zheng)體(ti)(ti)不(bu)(bu)如專制(zhi)政(zheng)體(ti)(ti)。章太炎闡述的，有三層意思：代議制(zhi)的民主共(gong)(gong)(gong)和(he)政(zheng)體(ti)(ti)不(bu)(bu)能(neng)行(xing)之(zhi)于中國；政(zheng)黨與(yu)議員勾結，這種共(gong)(gong)(gong)和(he)政(zheng)體(ti)(ti)還不(bu)(bu)如專制(zhi)政(zheng)體(ti)(ti)為宜。結論是(shi)建立共(gong)(gong)(gong)和(he)政(zheng)體(ti)(ti)只能(neng)是(shi)不(bu)(bu)得已之(zhi)舉。認(ren)為清朝推翻后，中國還是(shi)行(xing)專制(zhi)政(zheng)體(ti)(ti)為好。
章太炎早(zao)年(nian)在日(ri)本主(zhu)編(bian)《民報》時，曾(ceng)主(zhu)張社會主(zhu)義，與(yu)片山(shan)潛等(deng)日(ri)本社會主(zhu)義者過從甚密(mi)，并由(you)此反思西方的進化(hua)論(lun)及現(xian)代文明(ming)，撰寫(xie)了《俱分進化(hua)論(lun)》、《五無論(lun)》等(deng)著作。
章(zhang)太炎(yan)(yan)是(shi)近代中國(guo)國(guo)學(xue)(xue)大(da)師，也是(shi)學(xue)(xue)者型的(de)(de)資產階(jie)級革(ge)命(ming)(ming)家；但學(xue)(xue)術與政治畢竟不同，政治方(fang)面，章(zhang)太炎(yan)(yan)確有(you)他(ta)的(de)(de)局限，這些(xie)局限在辛亥革(ge)命(ming)(ming)及民國(guo)初年表現得很明顯(xian)。章(zhang)太炎(yan)(yan)的(de)(de)一些(xie)主(zhu)張與孫(sun)中山不同，但他(ta)仍是(shi)一位有(you)功于辛亥革(ge)命(ming)(ming)的(de)(de)民主(zhu)革(ge)命(ming)(ming)宣傳(chuan)家。
胡(hu)適則在《五十年來中(zhong)國之(zhi)文學》（1922年）中(zhong)說：“章炳(bing)麟的(de)古(gu)文學是(shi)五十年來的(de)第一作(zuo)家，這是(shi)無可疑的(de)。但他的(de)成(cheng)績只夠(gou)替古(gu)文學做一個很光榮的(de)下場，仍舊不(bu)能(neng)救古(gu)文學的(de)必(bi)死之(zhi)癥(zheng)，仍舊不(bu)能(neng)做到那‘取(qu)千年朽蠹(du)之(zhi)馀，反之(zhi)正則’的(de)盛業(ye)。”
梁啟超《清(qing)代學術概論(lun)》（1922年）稱章太炎為(wei)清(qing)學正統派的“殿軍”。
魯迅在1936年臨終時回憶其師(shi)章(zhang)太炎：“考(kao)其生平(ping)，以大勛(xun)章(zhang)作扇墜，臨總(zong)統府(fu)之(zhi)門，大詬袁世(shi)凱包藏(zang)禍(huo)心者，并世(shi)無第二人；七被追捕，三入牢(lao)獄，而革命之(zhi)志終不屈撓者，并世(shi)亦(yi)無第二人。這才(cai)是先哲的精神，后生的楷模。”
汪炳(bing)評價他(ta)是一位(wei)“有革命業(ye)績的學問家”。
薛慧山說(shuo)他是“權威性的(de)國學大師，推翻滿清的(de)革命先(xian)進”。
謝(xie)俊美(mei)認(ren)為他(ta)應(ying)該是一位“有革命業績(ji)的大(da)學(xue)問家”。
