聯盟于2014年12月22日，由(you)農業部(bu)、財政部(bu)主導(dao)成立，由(you)國(guo)家(jia)級、省級和地市級農業科研(yan)機構(gou)共同參(can)與(yu)。
聯盟的目標為通過重(zhong)大(da)科(ke)技任務牽引、優勢(shi)科(ke)研(yan)資源(yuan)集(ji)聚、科(ke)學運(yun)行(xing)機制保障(zhang)等(deng)手段，集(ji)聚全國(guo)農業科(ke)研(yan)優勢(shi)資源(yuan)和力量，構建統一高效的農業科(ke)技協同(tong)創(chuang)(chuang)新(xin)(xin)機制，促進原始創(chuang)(chuang)新(xin)(xin)、協同(tong)創(chuang)(chuang)新(xin)(xin)、管理創(chuang)(chuang)新(xin)(xin)和成果(guo)轉化創(chuang)(chuang)新(xin)(xin)，實現創(chuang)(chuang)新(xin)(xin)驅動現代農業發(fa)展。
| 序號 | 名稱 | 類型 |
| 1 | 健康油脂產業科技創新聯盟* | 產業聯盟 |
| 2 | 航空植保科技創新聯盟* | 產業聯盟 |
| 3 | 優質蜂產品科技創新聯盟 | 產業聯盟 |
| 4 | 鄉村環境治理科技創新聯盟 | 產業聯盟 |
| 5 | 蔬菜科技與產業創新聯盟 | 產業聯盟 |
| 6 | 草產業科技創新聯盟 | 產業聯盟 |
| 7 | 馬鈴薯產業科技創新聯盟 | 產業聯盟 |
| 8 | 鴿業科技創新聯盟* | 產業聯盟 |
| 9 | 牦牛產業提質增效科技創新聯盟 | 產業聯盟 |
| 10 | 畜牧科技創新聯盟* | 專業聯盟 |
| 11 | 農作物種質資源科技創新聯盟* | 專業聯盟 |
| 12 | 柑橘黃龍病綜合防控協同創新聯盟 | 專業聯盟 |
| 13 | 水稻綠色增產增效協同創新聯盟 | 專業聯盟 |
| 14 | 農產品質量安全科技創新聯盟 | 專業聯盟 |
| 15 | 安徽省農業科技創新聯盟 | 區域聯盟 |
| 16 | 山東省農業科技創新聯盟 | 區域聯盟 |
| 17 | 江西省農業科技創新聯盟 | 區域聯盟 |
| 序號 | 名稱 | 類型 |
| 1 | 棉花產業聯盟* | 產業聯盟 |
| 2 | 奶業科技創新聯盟* | 產業聯盟 |
| 3 | 天敵昆蟲科技創新聯盟* | 產業聯盟 |
| 4 | 高效復合肥料科技創新聯盟* | 產業聯盟 |
| 5 | 水稻商業化分子育種技術創新聯盟* | 產業聯盟 |
| 6 | 漁業裝備科技創新聯盟* | 產業聯盟 |
| 7 | 谷物收獲機械科技創新聯盟* | 產業聯盟 |
| 8 | 奶牛育種自主創新聯盟* | 產業聯盟 |
| 9 | 農業廢棄物循環利用科技創新聯盟 | 產業聯盟 |
| 10 | 高效低風險農藥科技創新聯盟 | 產業聯盟 |
| 11 | 化肥減量增效科技創新聯盟 | 產業聯盟 |
| 12 | 獸藥產業技術創新聯盟 | 產業聯盟 |
| 13 | 獼猴桃科技創新聯盟 | 產業聯盟 |
| 14 | 食藥同源產業科技創新聯盟 | 產業聯盟 |
| 15 | 智慧農業科技創新聯盟 | 產業聯盟 |
| 16 | 江蘇省農業科技創新聯盟* | 區域聯盟 |
| 17 | 陜西省農業科技創新聯盟* | 區域聯盟 |
| 18 | 熱區石漠化山地綠色高效農業科技創新聯盟* | 區域聯盟 |
| 19 | 東北區域玉米秸稈綜合利用協同創新聯盟* | 區域聯盟 |
| 20 | 湖北省農業科技創新聯盟* | 區域聯盟 |
| 21 | 廣東省農業科技創新聯盟 | 區域聯盟 |
| 22 | 甘肅省農業科技創新聯盟 | 區域聯盟 |
| 23 | 絲綢之路農業教育科技創新聯盟 | 區域聯盟 |
| 24 | 京津冀農業科技創新聯盟 | 區域聯盟 |
| 25 | 華北農業節水增效協同創新聯盟 | 區域聯盟 |
| 26 | 山西省農業科技創新聯盟 | 區域聯盟 |
| 27 | 農產品產地重金屬污染綜合防治協同創新聯盟 | 區域聯盟 |
| 28 | 湖南省農業科技創新聯盟 | 區域聯盟 |
| 29 | 湘鄂贛農業科技創新聯盟 | 區域聯盟 |
| 30 | 西北農林科技創新聯盟 | 區域聯盟 |
| 31 | 農業大數據與信息服務聯盟* | 專業聯盟 |
| 32 | 小麥赤霉病綜合防控協同創新聯盟* | 專業聯盟 |
| 33 | 農業基因組科技創新聯盟 | 專業聯盟 |
| 34 | 深藍漁業科技創新聯盟 | 專業聯盟 |
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