鹽田港口岸位于深圳大鵬灣海域西北部 ，南與香港九龍半島隔海相望，分為鹽田港區、下洞港區和廣東大鵬液化天然氣（LNG）專用碼頭，是深圳最大的水運口岸。鹽田港口岸建有大型集裝箱專用泊位15個，多用途泊位3個，可停泊10萬噸級以上大型集裝箱船舶，開通每周近100班遠洋國際集裝箱班輪；其中，鹽田港是我國四大國際中轉深水港之一。此外，鹽田港口岸還有2個特別區域，分別是下洞港區和廣東大鵬液化天然氣（LNG）專用碼頭，其中，下洞港區為深圳市東部石油、液化氣等危險品碼頭專用作業區。鹽田港口岸服務時間是全天候開放。詳細

蛇口口岸位于珠江口東岸、深圳市西部南頭半島南端，屬于水運口岸，是我國改革開放初期第一個由企業自籌資金建設、管理和經營的國家一類口岸，也是第一個由企業自籌資金建設、管理和經營的海港口岸。蛇口口岸已建成對外開放泊位共31個，其中集裝箱專用泊位10個，多用途泊位9個，修船專用泊位4個，客運泊位8個。蛇口口岸開放時間：貨運，全天候開放；太子灣郵輪母港（客運）服務時間為每天07:00至22:30。詳細

赤灣口岸位于珠江口東岸、深圳市西部的南頭半島西南端，是第一個中外合資港口企業建設和經營的海港口岸，屬于水運口岸，也是深圳西部港口群中規模僅次于蛇口港，功能集鐵路、公路、水路等運輸方式為一體的大型綜合性口岸。赤灣口岸于1982年8月動工興建， 1983年10月建成一個1萬噸級泊位并開港，1984年5月經國務院批準對外國籍船舶開放。港區現有泊位17個，其中集裝箱專用泊位6個，碼頭岸線總長3176米。赤灣口岸服務時間是全天候開放。詳細

媽灣口岸位于珠江口東岸，深圳市西部的南頭半島西側，東接赤灣港，南面向伶仃洋，是深圳六大水運口岸之一。媽灣口岸于1987年開始建設，1990年7月建成第一個3.5萬噸級多用途泊位，1990年2月經國務院批準對外國籍船舶開放，碼頭岸線總長3877米，該港區現有泊位14個（其中集裝箱專用泊位3個，煤碼頭專用泊位2個）。媽灣口岸服務時間是全天候開放。詳細

大鏟灣口岸位于珠江口仃洋礬石水道東南部，深圳西部媽灣港區以北的大鏟灣內，港區地理位置優越，水、陸路交通便捷，是深圳六大水運口岸之一。大鏟灣口岸區域岸線總長為11.6公里，陸域面積為10.28平方公里，擬建大型集裝箱深水泊位17個，中型泊位7個及19個駁船泊位，設計年吞吐能力為1250萬標箱。大鏟灣口岸于2005年9月開工建設，2009年5月，國務院批準對外國籍船舶開放。2011年11月，大鏟灣口岸正式通過國家口岸驗收。大鏟灣口岸服務時間是全天候開放。詳細

大亞灣口岸即是大亞灣核電站專用碼頭位于深圳市東部大亞灣畔的大坑村麻嶺角，是深圳水運口岸之一。距深圳市直線距離約45公里，距香港島約50公里。大亞灣核電站是由廣東核電投資有限公司和香港核電投資有限公司合營組成的廣東核電合營有限公司負責建設和經營。經國務院批準大亞灣核電站專用碼頭于1986年1月1日起對外國籍船舶開放。1987年3月和1989年6月，核電站專用碼頭和相關配套設備相繼竣工投入使用，該碼頭建有4個泊位（該口岸由大亞灣核電站專用，不對普通旅客開放，不對外經營，數據不公開）。詳細