無量山，古稱蒙樂山，位于云南省普洱市景東彝族自治縣西部，景東彝族自治縣境內面積2581平方千米。西北起于南澗彝族自治縣，向西南延伸至鎮沅、景谷等地，西至瀾滄江，東至川河；無量山，古稱蒙樂山，以“高聳入云不可躋，面大不可丈量之意”得名。山體支脈向東西兩翼擴展而呈扇形，地質結構有石灰巖、砂巖、頁巖、低谷、平壩和丘陵。生長針葉、闊葉及混交林，除思茅松分布較廣外，還生長著稀有珍貴林木。在原始森林中有虎、豹、熊、鹿、野豬、猴、山驢、巖羊、獐、孔雀、白鷴等動物。

西雙版納風景名勝區位于云南南部西雙版納傣族自治州境內，西雙版納距昆明740公里。西雙版納景區包括景洪市風景片區、勐海縣風景片區、勐臘縣風景片區三大塊。西雙版納每一塊內又有若干景區，西雙版納共有19個風景區，800多個景點，總面積1202.13平方公里。西雙版納有著種類繁多的動植物資源，被稱之為動、植物王國。西雙版納其中許多珍稀、古老、奇特、瀕危的動、植物又是西雙版納獨有的。

蒼山洱海國家級自然保護區位于云南大理白族自治州境內，由蒼山、洱海兩部分組成，地跨大理、洱海、漾濞等市、縣，總面積79700公頃。1993年升級為國家級自然保護區，面積79700公頃。大理蒼山洱海國家級自然保護區屬于自然生態系統類別，同時兼屬自然遺跡類別，其中包含三種類型：森林生態系統類型、內陸濕地和水域生態系統類型和地質遺跡類型，是一個多層次、多功能、大容量的綜合型自然保護區。以保護古冰川遺跡，高原湖泊自然景觀，弓魚等特有魚類，名勝古跡及蒼山冷山林為目的。

云南云龍天池國家級自然保護區位于云南省西北部大理白族自治州云龍縣境內，總面積14475公頃，在保護區內世界珍稀、特有野生動物除滇金絲猴外還有金錢豹、云豹、金雕、紅瘰疣螈、云南紅豆杉、云南榧樹等國家Ⅰ、Ⅱ級重點保護野生動植物40種以及大噪鹛、紅腹角雉、金江湍蛙、草綠龍蜥、云龍箭竹、云龍報春等眾多地區特有種。

文山國家級自然保護區，位于滇東南文山壯族苗族自治州的文山縣和西疇縣境內，處于北回歸線附近，國家級自然保護區。屬森林生態系統類型的自然保護區，以保護華蓋木、長蕊木蘭等多種木蘭科植物，及其生態環境，季風常綠闊葉林和山地苔蘚常綠闊葉林生態系統為目的。保護區是木蘭科植物的分布中心，木蘭科植物要求較高的森林生境和較高的濕度條件。

大圍山國家級自然保護區位于云南省東南部，地跨紅河哈尼族彝族自治州屏邊、河口、蒙自、個舊四縣（市），面積為43993hm2，其中核心區17379hm2，緩沖區14137hm2，實驗區12477hm2。屬森林生態系統類型的自然保護區。1986年3月，云南省人民政府批準建立大圍山省級自然保護區，2001年6月，國務院批準大圍山為國家級自然保護區。

高黎貢山國家級自然保護區地處云南省西北部的保山市和瀘水縣境內，怒江的西岸，位于北緯24°56′～28°23′，東經98°08′～98°53′之間。總面積405200hm2，是云南省面積最大的自然保護區。是國家級森林和野生動物類型自然保護區，以保護生物、氣候、垂直帶譜自然景觀、多種植被類型和多種珍稀瀕危保護動植物種類為目的。高黎貢山國家級自然保護區以其生物的多樣性，被學術界譽為“世界物種基因庫”，為世界生物圈保護區。1986年，經國務院批準成為國家級自然保護區。

哀牢山橫亙于云南省中部，“哀牢”在彝語中為“虎豹出沒的地方”，是云南境內的著名山脈，綿延一千公里，從大理州延伸到紅河州，是云貴高原和橫斷山脈的分界線，也是云貴高原自然氣候的天然屏障，還是元江和阿墨江的分水嶺。哀牢山主要由砂頁巖、石灰巖及各類變質巖組成，山體東部因沿斷裂帶下切較陡，相對高差大，西坡則較平緩。哀牢山景區旅游資源豐富，生態保持良好，擁有大片原始森林，為國家級自然保護區。

白馬雪山國家級自然保護區位于云南省西北部迪慶藏族自治州德欽和維西縣境內，附近的地貌形態十分復雜，與其它地區的地貌形態存在著巨大的差異；區地勢北高南低，處在青藏高原向云貴高原過渡接觸地帶，保護區的自然地理環境及生物資源十分豐富，過渡色彩非常明顯。白馬雪山自然保護區是中國面積大的滇金絲猴國家級自然保護區。主要保護對象為高山針葉林、山地植被垂直帶自然景觀和滇金絲猴。

云南元江國家級自然保護區保護區位于云南省中南部，玉溪市元江縣境內。云南元江國家級自然保護區總面積22378.9公頃，主要保護對象是中國干熱河谷典型的河谷型薩王納植被、較完整的山地常綠闊葉林和豐富的珍稀野生動植物資源，屬于森林生態系統自然保護區。2012年，保護區經國務院批準升級為國家級自然保護區。