在(zai)西(xi)方(fang)(fang),摩尼(ni)(ni)在(zai)世時,摩尼(ni)(ni)教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)已經傳(chuan)播到(dao)(dao)(dao)(dao)敘(xu)利亞、巴(ba)勒斯坦和(he)埃及(ji)。公(gong)元300年左右,摩尼(ni)(ni)教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)徒(tu)在(zai)埃及(ji)已經頗(po)有(you)聲(sheng)勢,以致于哲學家里(li)科普里(li)斯的(de)(de)(de)亞歷(li)山(shan)大(da)覺得有(you)必要撰文與(yu)其(qi)論(lun)(lun)戰。摩尼(ni)(ni)教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)又從埃及(ji)傳(chuan)播到(dao)(dao)(dao)(dao)北非(fei)和(he)西(xi)班牙,從敘(xu)利亞傳(chuan)播到(dao)(dao)(dao)(dao)小亞細亞,再從那里(li)傳(chuan)播到(dao)(dao)(dao)(dao)希臘、亞德里(li)亞海東(dong)岸、意(yi)大(da)利和(he)高盧。這些(xie)地方(fang)(fang)當時均在(zai)羅馬帝國統治之下(xia),摩尼(ni)(ni)教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)遭到(dao)(dao)(dao)(dao)政府的(de)(de)(de)粗暴(bao)迫害。皇帝戴克里(li)先於297年發布著(zhu)名(ming)的(de)(de)(de)詔書,命令非(fei)洲總督鎮壓摩尼(ni)(ni)教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)。基(ji)(ji)督教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)當時也遭到(dao)(dao)(dao)(dao)戴克里(li)先的(de)(de)(de)迫害,但是(shi)不久即取得國教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)地位(wei),將摩尼(ni)(ni)教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)視(shi)為(wei)最危險的(de)(de)(de)對手,不遺余力地從教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)俗兩方(fang)(fang)面(mian)進行斗(dou)爭(zheng)。執事馬克(Mark the Deacon)寫的(de)(de)(de)加沙主教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)波菲里(li)(Porphyry, the Bishop of Gaza)傳(chuan)中(zhong),記(ji)載了(le)375年波菲里(li)與(yu)摩尼(ni)(ni)教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)女信徒(tu)、來自安條(tiao)克的(de)(de)(de)朱莉(li)婭(Julia)的(de)(de)(de)一場辯論(lun)(lun)。圣(sheng)奧(ao)古(gu)斯丁(354-430)則記(ji)載了(le)他(ta)與(yu)摩尼(ni)(ni)教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)徒(tu)福圖那圖斯、費利克斯的(de)(de)(de)辯論(lun)(lun)。這些(xie)辯論(lun)(lun)正(zheng)是(shi)基(ji)(ji)督教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)與(yu)摩尼(ni)(ni)教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)斗(dou)爭(zheng)的(de)(de)(de)典型例(li)子。著(zhu)名(ming)的(de)(de)(de)希臘文教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)義之正(zheng)式聲(sheng)明(ming)說明(ming)遲至九世紀,摩尼(ni)(ni)教(jiao)(jiao)(jiao)(jiao)仍然在(zai)西(xi)方(fang)(fang)活動。不過(guo)1000年以后,在(zai)西(xi)方(fang)(fang)就不再看到(dao)(dao)(dao)(dao)關于他(ta)們(men)的(de)(de)(de)記(ji)載了(le)。
歐(ou)洲中世(shi)紀出現過(guo)所謂新摩(mo)尼(ni)教,比如(ru),7世(shi)紀亞(ya)美(mei)尼(ni)亞(ya)的保羅派(pai)(pai)(Paulicians)、10世(shi)紀保加利(li)亞(ya)的鮑格米勒派(pai)(pai)(Bogomilists)、和12世(shi)紀法國(guo)南部(bu)的阿爾(er)比派(pai)(pai)(Albigensians),都有類似摩(mo)尼(ni)教之處(chu),可能曾(ceng)受(shou)其(qi)影響。但(dan)是(shi)很難確定(ding)它們與摩(mo)尼(ni)教之間的直接(jie)歷史聯系。
在(zai)東方,薩珊王(wang)朝(chao)時(shi)(shi)(shi)期(qi)(224-651)摩(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)(jiao)(jiao)在(zai)波(bo)(bo)斯本(ben)土不斷遭(zao)到血腥迫(po)害(hai)(hai),它的(de)(de)主要(yao)力量逐漸匯聚到中(zhong)亞(ya)(ya)烏滸水(shui)(Oxus,今阿(a)(a)姆河)流域。粟(su)特城市薩秣建(撒(sa)馬爾(er)干)和(he)赭(zhe)時(shi)(shi)(shi)(塔什干)成為摩(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)(jiao)(jiao)傳播的(de)(de)重(zhong)要(yao)基地(di)。六世紀(ji)末,中(zhong)亞(ya)(ya)摩(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)(jiao)(jiao)團(tuan)在(zai)撒(sa)特-奧爾(er)米茲(Sad-Ohrmizd)領導(dao)下,與巴比倫(lun)的(de)(de)領袖(xiu)分(fen)裂,以(yi)(yi)電那勿(Denawars)派的(de)(de)名稱獨立。這種分(fen)裂狀態到八世紀(ji)初才結束,中(zhong)亞(ya)(ya)重(zhong)新接受(shou)巴比倫(lun)法王(wang)米爾(er)(Mihr,約710-740)的(de)(de)領導(dao)。七世紀(ji)中(zhong)葉,穆(mu)斯林征(zheng)服波(bo)(bo)斯以(yi)(yi)后,摩(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)(jiao)(jiao)徒(tu)(tu)的(de)(de)處(chu)境有所改善(shan),伍(wu)麥(mai)葉王(wang)朝(chao)(661-750)讓他(ta)們(men)和(he)平地(di)活動,可(ke)能根本(ben)沒有怎么(me)注(zhu)意(yi)他(ta)們(men)。阿(a)(a)拔(ba)斯王(wang)朝(chao)時(shi)(shi)(shi)期(qi)(750-1258),許多(duo)摩(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)(jiao)(jiao)文(wen)獻被翻(fan)(fan)譯(yi)成阿(a)(a)拉(la)伯文(wen),比如,伊本(ben)-穆(mu)蓋法耳(757年(nian)卒)曾(ceng)把摩(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)(ni)的(de)(de)幾本(ben)著作(zuo)(zuo)翻(fan)(fan)譯(yi)成阿(a)(a)拉(la)伯文(wen),比魯尼(ni)(ni)(ni)(ni)(ni)和(he)奈(nai)丁就是(shi)在(zai)一些摩(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)(jiao)(jiao)著作(zuo)(zuo)阿(a)(a)拉(la)伯文(wen)譯(yi)本(ben)的(de)(de)基礎上,撰寫摩(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)(jiao)(jiao)歷史的(de)(de)。同(tong)時(shi)(shi)(shi),阿(a)(a)拔(ba)斯王(wang)朝(chao)恢(hui)復了(le)(le)薩珊王(wang)朝(chao)反摩(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)(jiao)(jiao)的(de)(de)做法,譴責許多(duo)波(bo)(bo)斯血統(tong)的(de)(de)翻(fan)(fan)譯(yi)者是(shi)摩(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)(jiao)(jiao)的(de)(de)同(tong)情者。在(zai)麥(mai)海迪(di)(775-785)和(he)穆(mu)格臺(tai)迪(di)爾(er)(908-932)統(tong)治時(shi)(shi)(shi)期(qi),設立了(le)(le)專門處(chu)置異教(jiao)(jiao)(jiao)徒(tu)(tu)(主要(yao)是(shi)摩(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)(jiao)(jiao)徒(tu)(tu))的(de)(de)機(ji)構,無情地(di)對摩(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)(jiao)(jiao)徒(tu)(tu)進(jin)行迫(po)害(hai)(hai)。967年(nian)前奈(nai)丁在(zai)首(shou)都(dou)巴格達親身(shen)認識三百個摩(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)(jiao)(jiao)徒(tu)(tu),但是(shi),當(dang)他(ta)寫作(zuo)(zuo)《群書類述》時(shi)(shi)(shi),只(zhi)有五個還留在(zai)首(shou)都(dou),可(ke)見迫(po)害(hai)(hai)之激烈(lie)。可(ke)能公元1000年(nian)左右,摩(mo)(mo)尼(ni)(ni)(ni)(ni)(ni)教(jiao)(jiao)(jiao)徒(tu)(tu)在(zai)伊拉(la)克就滅絕了(le)(le)。