始建于梁天(tian)監二(er)年(nian)(nian)(503)，距今已(yi)1400多年(nian)(nian)。唐代興盛(sheng)佛(fo)教，德宗時翰林(lin)學士陸贄舍宅筑(zhu)基，名福業(ye)院，后改稱報(bao)國院。宋代大(da)中祥(xiang)符元年(nian)(nian)(1008)改稱承天(tian)院，政和(he)七(qi)年(nian)(nian)(1117)改稱能(neng)(neng)仁(ren)(ren)院。元順帝(di)至(zhi)正十六(liu)年(nian)(nian)(1356)毀于兵燹，明洪武(wu)二(er)十四年(nian)(nian)(1391)改稱為能(neng)(neng)仁(ren)(ren)教寺，正統二(er)年(nian)(nian)(1437)重修，清(qing)乾隆二(er)年(nian)(nian)(1737)稱能(neng)(neng)仁(ren)(ren)禪寺。
能仁寺(si)殿(dian)(dian)宇(yu)宏偉，氣勢雄渾，四周(zhou)環(huan)水，占(zhan)地70余(yu)畝(mu)。寺(si)院座北(bei)(bei)朝南，略顯長方(fang)形，主要建(jian)筑物(wu)分布(bu)于一(yi)條南北(bei)(bei)軸線及其(qi)東西兩(liang)側(ce)，山門直(zhi)對(dui)天仙橋。山門往(wang)北(bei)(bei)為(wei)金(jin)則殿(dian)(dian)、大(da)雄寶(bao)殿(dian)(dian)、華(hua)嚴(yan)閣。金(jin)剛殿(dian)(dian)前有(you)參天銀杏兩(liang)株及磚塔一(yi)對(dui)。大(da)殿(dian)(dian)東偏(pian)為(wei)紀(ji)念陸贄(zhi)建(jian)有(you)宣公(gong)祠(ci)，西偏(pian)為(wei)魯(lu)班殿(dian)(dian)、功德林。大(da)殿(dian)(dian)前為(wei)鐘(zhong)樓和鼓樓。寺(si)院周(zhou)圍僧(seng)房棋布(bu)，禪室(shi)羅列(lie)。共(gong)有(you)十二禪房，僧(seng)眾百余(yu)人，為(wei)遠近聞名的大(da)寺(si)院。
能仁(ren)(ren)寺(si)閱(yue)歷千載(zai)，幾經興衰，也有(you)許多感人(ren)故事。清朝末年，一場無情大火(huo)(huo)，能仁(ren)(ren)寺(si)又不(bu)幸被(bei)毀(hui)(hui)。當(dang)時中(zhong)醫沈季(ji)良妻邱氏(shi)身披袈裟，背負韋(wei)馱佛像(xiang)，手(shou)持木(mu)魚沿街三步一跪叩至外埠南(nan)當(dang)鎮化(hua)緣集(ji)資(zi)(zi)，歷經49天，終于感動富室(shi)獲(huo)得資(zi)(zi)助，重(zhong)(zhong)建大雄寶殿。1938年日(ri)軍(jun)入侵，能仁(ren)(ren)寺(si)又被(bei)大火(huo)(huo)焚(fen)毀(hui)(hui)。幸存的遺址(zhi)只有(you)華(hua)嚴閣臺基(ji)與蠶皇殿，近年有(you)關(guan)單位進行重(zhong)(zhong)建。不(bu)久我(wo)們可重(zhong)(zhong)見能仁(ren)(ren)寺(si)昔日(ri)的雄姿。
桂林(lin)(lin)能仁禪寺的(de)(de)(de)前(qian)身是原(yuan)廣(guang)(guang)西(xi)(xi)省(sheng)佛(fo)教(jiao)(jiao)會(hui)所在地(di)(di)。1939年(nian)初(chu)，年(nian)富國強、才華橫溢(yi)的(de)(de)(de)道安(an)法師(shi)應(ying)桂林(lin)(lin)僧俗禮請，從南岳祝圣寺來到桂林(lin)(lin)主持法會(hui)，追薦(jian)抗戰(zhan)以來死難同胞，祈禱世(shi)界(jie)和平。法會(hui)圓滿后(hou)，道安(an)法師(shi)應(ying)請留(liu)在桂林(lin)(lin)主持中國佛(fo)教(jiao)(jiao)會(hui)廣(guang)(guang)西(xi)(xi)省(sheng)分會(hui)的(de)(de)(de)工作。其時，身居要職的(de)(de)(de)廣(guang)(guang)西(xi)(xi)靖(jing)西(xi)(xi)專員黃昆山夫婦崇道安(an)法師(shi)為師(shi)皈依三寶后(hou)，發(fa)大(da)心于(yu)1938年(nian)8月在原(yuan)殘豐不(bu)堪的(de)(de)(de)地(di)(di)藏庵附近購地(di)(di)十數畝(mu)，交道安(an)法師(shi)主持募款建大(da)雄(xiong)寶殿(dian)，作為廣(guang)(guang)西(xi)(xi)省(sheng)佛(fo)教(jiao)(jiao)會(hui)永久(jiu)辦(ban)公地(di)(di)址，至1944年(nian)11月桂林(lin)(lin)淪陷，人員大(da)疏散前(qian)夕，經道安(an)法師(shi)5年(nian)多(duo)的(de)(de)(de)艱(jian)苦(ku)努力，廣(guang)(guang)西(xi)(xi)省(sheng)佛(fo)教(jiao)(jiao)已(yi)建成大(da)雄(xiong)寶殿(dian)、觀音(yin)殿(dian)、彌勒殿(dian)、方丈室(shi)、山門(men)等建筑，成為桂林(lin)(lin)市一個(ge)新的(de)(de)(de)弘法道場。
1940年(nian)秋，巨贊法師(shi)從南(nan)岳(yue)衡山(shan)輾(zhan)轉來到桂林，任廣西(xi)省佛(fo)(fo)教(jiao)(jiao)會秘書長，并于當年(nian)12月(yue)15日(ri)同道安法師(shi)一道創(chuang)辦、主編、出版《獅子吼月(yue)刊》 ，以桂林為實驗基地開(kai)展“新佛(fo)(fo)教(jiao)(jiao)運動”，歷時一年(nian)多。抗戰(zhan)(zhan)勝利(li)前(qian)夕，桂林慘遭日(ri)軍飛機狂轟濫炸(zha)，全城98%以上的房屋被毀，而廣西(xi)省佛(fo)(fo)教(jiao)(jiao)會幸(xing)賴佛(fo)(fo)力加被得免于難。抗戰(zhan)(zhan)勝利(li)后(hou)，道安法師(shi)從外地返回桂林，繼續艱(jian)難主持省佛(fo)(fo)教(jiao)(jiao)會。后(hou)來，由于戰(zhan)(zhan)云密布(bu)、時局動蕩，道安法師(shi)輾(zhan)轉赴臺發展，駐錫于臺北松山(shan)寺。
1949年(nian)后，廣西省(sheng)佛(fo)教(jiao)(jiao)會(hui)自(zi)行(xing)解體。1950年(nian)桂(gui)林(lin)市(shi)(shi)(shi)進行(xing)社團登記時，廣西省(sheng)佛(fo)教(jiao)(jiao)會(hui)所在(zai)地以(yi)桂(gui)林(lin)市(shi)(shi)(shi)佛(fo)教(jiao)(jiao)會(hui)的(de)名義進行(xing)登記，負責(ze)人先后有釋自(zi)禪(chan) 、釋海圓、釋自(zi)如、釋明(ming)德等。“文革”期(qi)間(jian)，佛(fo)教(jiao)(jiao)會(hui)所在(zai)地被多(duo)家單(dan)位瓜分、占(zhan)用，佛(fo)教(jiao)(jiao)蕩然無(wu)存，大(da)雄寶殿和觀音殿內(nei)不聞梵唄清(qing)音。1986年(nian)9月，在(zai)市(shi)(shi)(shi)政府協助下，桂(gui)林(lin)市(shi)(shi)(shi)第一(yi)屆佛(fo)教(jiao)(jiao)徒代表大(da)會(hui)召開，正式成立桂(gui)林(lin)市(shi)(shi)(shi)佛(fo)教(jiao)(jiao)協會(hui)，確定原廣西省(sheng)佛(fo)教(jiao)(jiao)會(hui)所在(zai)地定名為“桂(gui)林(lin)市(shi)(shi)(shi)能(neng)(neng)仁(ren)禪(chan)寺(si)”，能(neng)(neng)仁(ren)禪(chan)寺(si)院住持(chi)慧(hui)玉(yu)(yu)當(dang)選(xuan)為市(shi)(shi)(shi)佛(fo)教(jiao)(jiao)協會(hui)會(hui)長；在(zai)市(shi)(shi)(shi)政府負責(ze)遷走占(zhan)用寺(si)院的(de)工廣后，由比丘尼慧(hui)玉(yu)(yu)法師(shi)主持(chi)募緣維修(xiu)能(neng)(neng)仁(ren)禪(chan)寺(si)，寺(si)院作為比丘尼道(dao)場管理。1992年(nian)10月慧(hui)玉(yu)(yu)法師(shi)圓寂后，由從(cong)法法師(shi)接任能(neng)(neng)仁(ren)禪(chan)寺(si)住持(chi)至今。
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